NCOR1

NCOR1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EQR, 3H52, 3KMZ, 3N00, 4MDD, 4WVD
Ідентифікатори
Символи	NCOR1, N-CoR, N-CoR1, PPP1R109, TRAC1, hN-CoR, nuclear receptor corepressor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600849 MGI: 1349717 HomoloGene: 38166 GeneCards: NCOR1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • histone deacetylase binding • thyroid hormone receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear receptor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • chromatin binding • sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • histone deacetylase complex • мембрана • transcription repressor complex • Sin3 complex • spindle microtubule • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • mitotic spindle Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • negative regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • spindle assembly • negative regulation of JNK cascade • regulation of fatty acid transport • циркадний ритм • transcription, DNA-templated • regulation of lipid metabolic process • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of androgen receptor signaling pathway • locomotor rhythm • ритмічний процес Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9611	20185
Ensembl	ENSG00000141027	ENSMUSG00000018501
UniProt	O75376	Q60974
RefSeq (мРНК)	NM_001190438 NM_001190440 NM_006311	NM_001252313 NM_011308 NM_177229
RefSeq (білок)	NP_001177367 NP_001177369 NP_006302	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 17: 16.03 – 16.22 Mb	Хр. 11: 62.21 – 62.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NCOR1 (англ. Nuclear receptor corepressor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 440 амінокислот, а молекулярна маса — 270 210.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSSSGYPPNQ		GAFSTEQSRY		PPHSVQYTFP		NTRHQQEFAV		PDYRSSHLEV
SQASQLLQQQ		QQQQLRRRPS		LLSEFHPGSD		RPQERRTSYE		PFHPGPSPVD
HDSLESKRPR		LEQVSDSHFQ		RVSAAVLPLV		HPLPEGLRAS		ADAKKDPAFG
GKHEAPSSPI		SGQPCGDDQN		ASPSKLSKEE		LIQSMDRVDR		EIAKVEQQIL
KLKKKQQQLE		EEAAKPPEPE		KPVSPPPVEQ		KHRSIVQIIY		DENRKKAEEA
HKIFEGLGPK		VELPLYNQPS		DTKVYHENIK		TNQVMRKKLI		LFFKRRNHAR
KQREQKICQR		YDQLMEAWEK		KVDRIENNPR		RKAKESKTRE		YYEKQFPEIR
KQREQQERFQ		RVGQRGAGLS		ATIARSEHEI		SEIIDGLSEQ		ENNEKQMRQL
SVIPPMMFDA		EQRRVKFINM		NGLMEDPMKV		YKDRQFMNVW		TDHEKEIFKD
KFIQHPKNFG		LIASYLERKS		VPDCVLYYYL		TKKNENYKAL		VRRNYGKRRG
RNQQIARPSQ		EEKVEEKEED		KAEKTEKKEE		EKKDEEEKDE		KEDSKENTKE
KDKIDGTAEE		TEEREQATPR		GRKTANSQGR		RKGRITRSMT		NEAAAASAAA
AAATEEPPPP		LPPPPEPIST		EPVETSRWTE		EEMEVAKKGL		VEHGRNWAAI
AKMVGTKSEA		QCKNFYFNYK		RRHNLDNLLQ		QHKQKTSRKP		REERDVSQCE
SVASTVSAQE		DEDIEASNEE		ENPEDSEVEA		VKPSEDSPEN		ATSRGNTEPA
VELEPTTETA		PSTSPSLAVP		STKPAEDESV		ETQVNDSISA		ETAEQMDVDQ
QEHSAEEGSV		CDPPPATKAD		SVDVEVRVPE		NHASKVEGDN		TKERDLDRAS
EKVEPRDEDL		VVAQQINAQR		PEPQSDNDSS		ATCSADEDVD		GEPERQRMFP
MDSKPSLLNP		TGSILVSSPL		KPNPLDLPQL		QHRAAVIPPM		VSCTPCNIPI
GTPVSGYALY		QRHIKAMHES		ALLEEQRQRQ		EQIDLECRSS		TSPCGTSKSP
NREWEVLQPA		PHQVITNLPE		GVRLPTTRPT		RPPPPLIPSS		KTTVASEKPS
FIMGGSISQG		TPGTYLTSHN		QASYTQETPK		PSVGSISLGL		PRQQESAKSA
TLPYIKQEEF		SPRSQNSQPE		GLLVRAQHEG		VVRGTAGAIQ		EGSITRGTPT
SKISVESIPS		LRGSITQGTP		ALPQTGIPTE		ALVKGSISRM		PIEDSSPEKG
REEAASKGHV		IYEGKSGHIL		SYDNIKNARE		GTRSPRTAHE		ISLKRSYESV
EGNIKQGMSM		RESPVSAPLE		GLICRALPRG		SPHSDLKERT		VLSGSIMQGT
PRATTESFED		GLKYPKQIKR		ESPPIRAFEG		AITKGKPYDG		ITTIKEMGRS
IHEIPRQDIL		TQESRKTPEV		VQSTRPIIEG		SISQGTPIKF		DNNSGQSAIK
HNVKSLITGP		SKLSRGMPPL		EIVPENIKVV		ERGKYEDVKA		GETVRSRHTS
VVSSGPSVLR		STLHEAPKAQ		LSPGIYDDTS		ARRTPVSYQN		TMSRGSPMMN
RTSDVTISSN		KSTNHERKST		LTPTQRESIP		AKSPVPGVDP		VVSHSPFDPH
HRGSTAGEVY		RSHLPTHLDP		AMPFHRALDP		AAAAYLFQRQ		LSPTPGYPSQ
YQLYAMENTR		QTILNDYITS		QQMQVNLRPD		VARGLSPREQ		PLGLPYPATR
GIIDLTNMPP		TILVPHPGGT		STPPMDRITY		IPGTQITFPP		RPYNSASMSP
GHPTHLAAAA		SAERERERER		EKERERERIA		AASSDLYLRP		GSEQPGRPGS
HGYVRSPSPS		VRTQETMLQQ		RPSVFQGTNG		TSVITPLDPT		AQLRIMPLPA
GGPSISQGLP		ASRYNTAADA		LAALVDAAAS		APQMDVSKTK		ESKHEAARLE
ENLRSRSAAV		SEQQQLEQKT		LEVEKRSVQC		LYTSSAFPSG		KPQPHSSVVY
SEAGKDKGPP		PKSRYEEELR		TRGKTTITAA		NFIDVIITRQ		IASDKDARER
GSQSSDSSSS		LSSHRYETPS		DAIEVISPAS		SPAPPQEKLQ		TYQPEVVKAN
QAENDPTRQY		EGPLHHYRPQ		QESPSPQQQL		PPSSQAEGMG		QVPRTHRLIT
LADHICQIIT		QDFARNQVSS		QTPQQPPTST		FQNSPSALVS		TPVRTKTSNR
YSPESQAQSV		HHQRPGSRVS		PENLVDKSRG		SRPGKSPERS		HVSSEPYEPI
SPPQVPVVHE		KQDSLLLLSQ		RGAEPAEQRN		DARSPGSISY		LPSFFTKLEN
TSPMVKSKKQ		EIFRKLNSSG		GGDSDMAAAQ		PGTEIFNLPA		VTTSGSVSSR
GHSFADPASN		LGLEDIIRKA		LMGSFDDKVE		DHGVVMSQPM		GVVPGTANTS
VVTSGETRRE		EGDPSPHSGG		VCKPKLISKS		NSRKSKSPIP		GQGYLGTERP
SSVSSVHSEG		DYHRQTPGWA		WEDRPSSTGS		TQFPYNPLTM		RMLSSTPPTP
IACAPSAVNQ		AAPHQQNRIW		EREPAPLLSA		QYETLSDSDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Wang J., Hoshino T., Redner R.L., Kajigaya S., Liu J.M. (1998). ETO, fusion partner in t(8;21) acute myeloid leukemia, represses transcription by interaction with the human N-CoR/mSin3/HDAC1 complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 10860—10865. PMID 9724795 DOI:10.1073/pnas.95.18.10860
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Harding H.P., Atkins G.B., Jaffe A.B., Seo W.J., Lazar M.A. (1997). Transcriptional activation and repression by RORalpha, an orphan nuclear receptor required for cerebellar development. Mol. Endocrinol. 11: 1737—1746. PMID 9328355 DOI:10.1210/mend.11.11.0002
• Underhill C., Qutob M.S., Yee S.P., Torchia J. (2000). A novel nuclear receptor corepressor complex, N-CoR, contains components of the mammalian SWI/SNF complex and the corepressor KAP-1. J. Biol. Chem. 275: 40463—40470. PMID 11013263 DOI:10.1074/jbc.M007864200
• Zhang J., Kalkum M., Chait B.T., Roeder R.G. (2002). The N-CoR-HDAC3 nuclear receptor corepressor complex inhibits the JNK pathway through the integral subunit GPS2. Mol. Cell. 9: 611—623. PMID 11931768 DOI:10.1016/S1097-2765(02)00468-9
• Yoon H.-G., Chan D.W., Reynolds A.B., Qin J., Wong J. (2003). N-CoR mediates DNA methylation-dependent repression through a methyl CpG binding protein Kaiso. Mol. Cell. 12: 723—734. PMID 14527417 DOI:10.1016/j.molcel.2003.08.008

Див. також

• Хромосома 17