PCDH9

PCDH9
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2EE0
Ідентифікатори
Символи	PCDH9, protocadherin 9
Зовнішні ІД	OMIM: 603581 MGI: 1306801 HomoloGene: 10698 GeneCards: PCDH9
Пов'язані генетичні захворювання
карієс зубів, ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding Клітинна компонента • growth cone • integral component of membrane • клітинна мембрана • мембрана • cell-cell contact zone • integral component of plasma membrane Біологічний процес • forebrain development • адгезія клітин • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5101	211712
Ensembl	ENSG00000184226	ENSMUSG00000055421
UniProt	Q9HC56	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_020403 NM_203487 NM_001318372 NM_001318373 NM_001318374	NM_001081377 NM_001271798 NM_001271799 NM_001271800 NM_001346722
RefSeq (білок)	NP_001305301 NP_001305302 NP_001305303 NP_065136 NP_982354	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 13: 66.3 – 67.23 Mb	Хр. 14: 93.25 – 94.13 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PCDH9 (англ. Protocadherin 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 237 амінокислот, а молекулярна маса — 136 064.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLRDFYLLA		ALIACLRLDS		AIAQELIYTI		REELPENVPI		GNIPKDLNIS
HINAATGTSA		SLVYRLVSKA		GDAPLVKVSS		STGEIFTTSN		RIDREKLCAG
ASYAEENECF		FELEVVILPN		DFFRLIKIKI		IVKDTNDNAP		MFPSPVINIS
IPENTLINSR		FPIPSATDPD		TGFNGVQHYE		LLNGQSVFGL		DIVETPEGEK
WPQLIVQQNL		DREQKDTYVM		KIKVEDGGTP		QKSSTAILQV		TVSDVNDNRP
VFKEGQVEVH		IPENAPVGTS		VIQLHATDAD		IGSNAEIRYI		FGAQVAPATK
RLFALNNTTG		LITVQRSLDR		EETAIHKVTV		LASDGSSTPA		RATVTINVTD
VNDNPPNIDL		RYIISPINGT		VYLSEKDPVN		TKIALITVSD		KDTDVNGKVI
CFIEREVPFH		LKAVYDNQYL		LETSSLLDYE		GTKEFSFKIV		ASDSGKPSLN
QTALVRVKLE		DENDNPPIFN		QPVIELSVSE		NNRRGLYLTT		ISATDEDSGK
NADIVYQLGP		NASFFDLDRK		TGVLTASRVF		DREEQERFIF		TVTARDNGTP
PLQSQAAVIV		TVLDENDNSP		KFTHNHFQFF		VSENLPKYST		VGVITVTDAD
AGENKAVTLS		ILNDNDNFVL		DPYSGVIKSN		VSFDREQQSS		YTFDVKATDG
GQPPRSSTAK		VTINVMDVND		NSPVVISPPS		NTSFKLVPLS		AIPGSVVAEV
FAVDVDTGMN		AELKYTIVSG		NNKGLFRIDP		VTGNITLEEK		PAPTDVGLHR
LVVNISDLGY		PKSLHTLVLV		FLYVNDTAGN		ASYIYDLIRR		TMETPLDRNI
GDSSQPYQNE		DYLTIMIAII		AGAMVVIVVI		FVTVLVRCRH		ASRFKAAQRS
KQGAEWMSPN		QENKQNKKKK		RKKRKSPKSS		LLNFVTIEES		KPDDAVHEPI
NGTISLPAEL		EEQSIGRFDW		GPAPPTTFKP		NSPDLAKHYK		SASPQPAFHL
KPDTPVSVKK		HHVIQELPLD		NTFVGGCDTL		SKRSSTSSDH		FSASECSSQG
GFKTKGPLHT		RQCNSHSKSD		NIPVTPQKCP		SSTGFHIQEN		EESHYESQRR
VTFHLPDGSQ		ESCSDSGLGD		HEPVGSGTLI		SHPLPLVQPQ		DEFYDQASPD
KRTEADGNSD		PNSDGPLGPR		GLAEATEMCT		QECLVLGHSD		NCWMPPGLGP
YQHPKSPLST		FAPQKEWVKK		DKLVNGHTLT		RAWKEDSNRN		QFNDRKQYGS
NEGHFNNGSH		MTDIPLANLK		SYKQAGGATE		SPKEHQL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13