PDCD6IP

PDCD6IP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2OEV, 2OEW, 2OEX, 2OJQ, 2R02, 2R03, 2R05, 2XS1, 2XS8, 2ZNE, 3C3O, 3C3Q, 3C3R, 3E1R, 3WUV, 4JJY
Ідентифікатори
Символи	PDCD6IP, AIP1, ALIX, DRIP4, HP95, programmed cell death 6 interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 608074 MGI: 1333753 HomoloGene: 22614 GeneCards: PDCD6IP
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein homodimerization activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein dimerization activity; • proteinase activated receptor binding; • calcium-dependent protein binding;
Клітинна компонента	• immunological synapse; • focal adhesion; • центр організації мікротрубочок; • extracellular vesicle; • endoplasmic reticulum exit site; • extracellular region; • myelin sheath; • цитоскелет; • Меланосома; • мембрана; • екзосома; • цитоплазма; • гіалоплазма; • actomyosin; • bicellular tight junction; • міжклітинні контакти; • Flemming body;
Біологічний процес	• клітинний цикл; • mitotic metaphase plate congression; • protein transport; • positive regulation of exosomal secretion; • GO:0019067 viral life cycle; • regulation of mitotic spindle assembly; • ubiquitin-independent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway; • positive regulation of extracellular exosome assembly; • septum digestion after cytokinesis; • regulation of centrosome duplication; • nucleus organization; • multivesicular body assembly; • regulation of extracellular exosome assembly; • GO:0097285 апоптоз; • поділ клітини; • viral budding via host ESCRT complex; • GO:0022415 viral process; • actomyosin contractile ring assembly; • maintenance of epithelial cell apical/basal polarity; • bicellular tight junction assembly; • regulation of membrane permeability; • mitotic cytokinesis; • viral budding; • protein homooligomerization; • GO:0015915 транспорт; • midbody abscission;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10015
	18571
	ENSG00000170248
	ENSMUSG00000032504
	Q8WUM4
	Q9WU78
	NM_001162429; NM_001256192; NM_013374
	NM_001164677; NM_001164678; NM_011052
	NP_001155901; NP_001243121; NP_037506
	NP_001158149; NP_001158150; NP_035182
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

PDCD6IP (англ. Programmed cell death 6 interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 868 амінокислот, а молекулярна маса — 96 023^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATFISVQLK	KTSEVDLAKP	LVKFIQQTYP	SGGEEQAQYC	RAAEELSKLR
RAAVGRPLDK	HEGALETLLR	YYDQICSIEP	KFPFSENQIC	LTFTWKDAFD
KGSLFGGSVK	LALASLGYEK	SCVLFNCAAL	ASQIAAEQNL	DNDEGLKIAA
KHYQFASGAF	LHIKETVLSA	LSREPTVDIS	PDTVGTLSLI	MLAQAQEVFF
LKATRDKMKD	AIIAKLANQA	ADYFGDAFKQ	CQYKDTLPKE	VFPVLAAKHC
IMQANAEYHQ	SILAKQQKKF	GEEIARLQHA	AELIKTVASR	YDEYVNVKDF
SDKINRALAA	AKKDNDFIYH	DRVPDLKDLD	PIGKATLVKS	TPVNVPISQK
FTDLFEKMVP	VSVQQSLAAY	NQRKADLVNR	SIAQMREATT	LANGVLASLN
LPAAIEDVSG	DTVPQSILTK	SRSVIEQGGI	QTVDQLIKEL	PELLQRNREI
LDESLRLLDE	EEATDNDLRA	KFKERWQRTP	SNELYKPLRA	EGTNFRTVLD
KAVQADGQVK	ECYQSHRDTI	VLLCKPEPEL	NAAIPSANPA	KTMQGSEVVN
VLKSLLSNLD	EVKKEREGLE	NDLKSVNFDM	TSKFLTALAQ	DGVINEEALS
VTELDRVYGG	LTTKVQESLK	KQEGLLKNIQ	VSHQEFSKMK	QSNNEANLRE
EVLKNLATAY	DNFVELVANL	KEGTKFYNEL	TEILVRFQNK	CSDIVFARKT
ERDELLKDLQ	QSIAREPSAP	SIPTPAYQSS	PAGGHAPTPP	TPAPRTMPPT
KPQPPARPPP	PVLPANRAPS	ATAPSPVGAG	TAAPAPSQTP	GSAPPPQAQG
PPYPTYPGYP	GYCQMPMPMG	YNPYAYGQYN	MPYPPVYHQS	PGQAPYPGPQ
QPSYPFPQPP	QQSYYPQQ

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, взаємодія хазяїн-вірус, транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, щільних контактах. Також секретований назовні.

Література[ред. | ред. код]

Wang P., Yu P., Gao P., Shi T., Ma D. (2009). Discovery of novel human transcript variants by analysis of intronic single-block EST with polyadenylation site. BMC Genomics. 10: 518—518. PMID 19906316 DOI:10.1186/1471-2164-10-518
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
Strack B., Calistri A., Craig S., Popova E., Goettlinger H.G. (2003). AIP1/ALIX is a binding partner for HIV-1 p6 and EIAV p9 functioning in virus budding. Cell. 114: 689—699. PMID 14505569 DOI:10.1016/S0092-8674(03)00653-6
Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
Katoh K., Shibata H., Hatta K., Maki M. (2004). CHMP4b is a major binding partner of the ALG-2-interacting protein Alix among the three CHMP4 isoforms. Arch. Biochem. Biophys. 421: 159—165. PMID 14678797 DOI:10.1016/j.abb.2003.09.038