PSMC3

PSMC3
Ідентифікатори
Символи	PSMC3, TBP1, proteasome 26S subunit, ATPase 3, RPT5, DCIDP
Зовнішні ІД	OMIM: 186852 MGI: 1098754 HomoloGene: 2097 GeneCards: PSMC3
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ATPase activity • hydrolase activity • TBP-class protein binding • ATP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • proteasome-activating activity Клітинна компонента • нуклеоплазма • цитоплазма • proteasome regulatory particle, base subcomplex • гіалоплазма • cytosolic proteasome complex • мембрана • P-body • proteasome accessory complex • nuclear proteasome complex • Протеасома • extracellular region • secretory granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • клітинне ядро Біологічний процес • NIK/NF-kappaB signaling • MAPK cascade • regulation of mRNA stability • protein polyubiquitination • Fc-epsilon receptor signaling pathway • regulation of cellular amino acid metabolic process • GO:0044257 protein catabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • blastocyst development • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • ubiquitin-dependent ERAD pathway • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly • T cell receptor signaling pathway • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of proteasomal protein catabolic process • GO:0022415 viral process • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • neutrophil degranulation • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • modulation by host of viral transcription • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5702	19182
Ensembl	ENSG00000165916	ENSMUSG00000002102
UniProt	P17980	O88685
RefSeq (мРНК)	NM_002804	NM_008948
RefSeq (білок)	NP_002795	NP_032974
Локус (UCSC)	Хр. 11: 47.42 – 47.43 Mb	Хр. 2: 90.88 – 90.9 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PSMC3 (англ. Proteasome 26S subunit, ATPase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот, а молекулярна маса — 49 204.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNLLPNIESP		VTRQEKMATV		WDEAEQDGIG		EEVLKMSTEE		IIQRTRLLDS
EIKIMKSEVL		RVTHELQAMK		DKIKENSEKI		KVNKTLPYLV		SNVIELLDVD
PNDQEEDGAN		IDLDSQRKGK		CAVIKTSTRQ		TYFLPVIGLV		DAEKLKPGDL
VGVNKDSYLI		LETLPTEYDS		RVKAMEVDER		PTEQYSDIGG		LDKQIQELVE
AIVLPMNHKE		KFENLGIQPP		KGVLMYGPPG		TGKTLLARAC		AAQTKATFLK
LAGPQLVQMF		IGDGAKLVRD		AFALAKEKAP		SIIFIDELDA		IGTKRFDSEK
AGDREVQRTM		LELLNQLDGF		QPNTQVKVIA		ATNRVDILDP		ALLRSGRLDR
KIEFPMPNEE		ARARIMQIHS		RKMNVSPDVN		YEELARCTDD		FNGAQCKAVC
VEAGMIALRR		GATELTHEDY		MEGILEVQAK		KKANLQYYA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nelbock P., Dillion P.J., Perkins A., Rosen C.A. (1990). A cDNA for a protein that interacts with the human immunodeficiency virus Tat transactivator. Science. 248: 1650—1653. PMID 2194290 DOI:10.1126/science.2194290

Див. також

• Хромосома 11