RAB3IP

RAB3IP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4LHX, 4LHY, 4LHZ, 4UJ3, 4UJ4, 4UJ5
Ідентифікатори
Символи	RAB3IP, RABIN3, RABIN8, RAB3A interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 608686 MGI: 105933 HomoloGene: 32340 GeneCards: RAB3IP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • guanyl-nucleotide exchange factor activity • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • ciliary basal body • гіалоплазма • центросома • cell projection • цитоскелет • lamellipodium • клітинне ядро Біологічний процес • protein localization to organelle • protein transport • Golgi to plasma membrane transport • protein targeting to membrane • cilium assembly • ciliary basal body-plasma membrane docking Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	117177	216363
Ensembl	ENSG00000127328	ENSMUSG00000064181
UniProt	Q96QF0	Q68EF0
RefSeq (мРНК)	NM_001024647 NM_001278402 NM_022456 NM_175623 NM_175624 NM_175625 NM_175626 NM_175627	NM_001003950 NM_001359645
RefSeq (білок)	NP_001019818 NP_001265331 NP_071901 NP_783322 NP_783323 NP_783324	NP_001003950 NP_001346574
Локус (UCSC)	Хр. 12: 69.74 – 69.82 Mb	Хр. 10: 116.74 – 116.79 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAB3IP (англ. RAB3A interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 53 021.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLKKMKGLS		YDEAFAMAND		PLEGFHEVNL		ASPTSPDLLG		VYESGTQEQT
TSPSVIYRPH		PSALSSVPIQ		ANALDVSELP		TQPVYSSPRR		LNCAEISSIS
FHVTDPAPCS		TSGVTAGLTK		LTTRKDNYNA		EREFLQGATI		TEACDGSDDI
FGLSTDSLSR		LRSPSVLEVR		EKGYERLKEE		LAKAQRELKL		KDEECERLSK
VRDQLGQELE		ELTASLFEEA		HKMVREANIK		QATAEKQLKE		AQGKIDVLQA
EVAALKTLVL		SSSPTSPTQE		PLPGGKTPFK		KGHTRNKSTS		SAMSGSHQDL
SVIQPIVKDC		KEADLSLYNE		FRLWKDEPTM		DRTCPFLDKI		YQEDIFPCLT
FSKSELASAV		LEAVENNTLS		IEPVGLQPIR		FVKASAVECG		GPKKCALTGQ
SKSCKHRIKL		GDSSNYYYIS		PFCRYRITSV		CNFFTYIRYI		QQGLVKQQDV
DQMFWEVMQL		RKEMSLAKLG		YFKEEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, клітинних відростках.

Література

• Hattula K., Furuhjelm J., Arffman A., Peranen J. (2002). A Rab8-specific GDP/GTP exchange factor is involved in actin remodeling and polarized membrane transport. Mol. Biol. Cell. 13: 3268—3280. PMID 12221131 DOI:10.1091/mbc.E02-03-0143
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yoshimura S., Gerondopoulos A., Linford A., Rigden D.J., Barr F.A. (2010). Family-wide characterization of the DENN domain Rab GDP-GTP exchange factors. J. Cell Biol. 191: 367—381. PMID 20937701 DOI:10.1083/jcb.201008051

Див. також

• Хромосома 12