RAD51AP1

RAD51AP1
Ідентифікатори
Символи	RAD51AP1, PIR51, RAD51 associated protein 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603070 MGI: 1098224 HomoloGene: 48436 GeneCards: RAD51AP1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • double-stranded DNA binding • single-stranded DNA binding Клітинна компонента • нуклеоплазма • клітинне ядро • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • cellular response to ionizing radiation • DNA recombination • GO:0100026 Репарація ДНК • regulation of double-strand break repair via homologous recombination • cellular response to DNA damage stimulus • double-strand break repair via homologous recombination • interstrand cross-link repair Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10635	19362
Ensembl	ENSG00000111247	ENSMUSG00000030346
UniProt	Q96B01	Q8C551
RefSeq (мРНК)	NM_001130862 NM_006479	NM_009013 NM_001347455
RefSeq (білок)	NP_001124334 NP_006470	NP_001334384 NP_033039
Локус (UCSC)	Хр. 12: 4.54 – 4.56 Mb	Хр. 6: 126.9 – 126.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAD51AP1 (англ. RAD51 associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 38 457.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVRPVRHKKP		VNYSQFDHSD		SDDDFVSATV		PLNKKSRTAP		KELKQDKPKP
NLNNLRKEEI		PVQEKTPKKR		LPEGTFSIPA		SAVPCTKMAL		DDKLYQRDLE
VALALSVKEL		PTVTTNVQNS		QDKSIEKHGS		SKIETMNKSP		HISNCSVASD
YLDLDKITVE		DDVGGVQGKR		KAASKAAAQQ		RKILLEGSDG		DSANDTEPDF
APGEDSEDDS		DFCESEDNDE		DFSMRKSKVK		EIKKKEVKVK		SPVEKKEKKS
KSKCNALVTS		VDSAPAAVKS		ESQSLPKKVS		LSSDTTRKPL		EIRSPSAESK
KPKWVPPAAS		GGSRSSSSPL		VVVSVKSPNQ		SLRLGLSRLA		RVKPLHPNAT
ST

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Kovalenko O.V., Golub E.I., Bray-Ward P., Ward D.C., Radding C.M. (1997). A novel nucleic acid-binding protein that interacts with human rad51 recombinase. Nucleic Acids Res. 25: 4946—4953. PMID 9396801 DOI:10.1093/nar/25.24.4946
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kovalenko O.V., Wiese C., Schild D. (2006). RAD51AP2, a novel vertebrate- and meiotic-specific protein, shares a conserved RAD51-interacting C-terminal domain with RAD51AP1/PIR51. Nucleic Acids Res. 34: 5081—5092. PMID 16990250 DOI:10.1093/nar/gkl665
• Yuan J., Chen J. (2013). FIGNL1-containing protein complex is required for efficient homologous recombination repair. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 110: 10640—10645. PMID 23754376 DOI:10.1073/pnas.1220662110

Див. також

• Хромосома 12