RIOX2

RIOX2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XDV, 4BU2, 4BXF
Ідентифікатори
Символи	RIOX2, MDIG, MINA53, NO52, ROX, MINA, MYC-induced nuclear antigen, MYC induced nuclear antigen, ribosomal oxygenase 2, JMJD10
Зовнішні ІД	OMIM: 612049 MGI: 1914264 HomoloGene: 12071 GeneCards: RIOX2
Онтологія гена Молекулярна функція • oxidoreductase activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • histone demethylase activity • identical protein binding • histone H3-methyl-lysine-4 demethylase activity • histone H3-methyl-lysine-36 demethylase activity • GO:0001106 transcription corepressor activity Клітинна компонента • ядерце • transcription regulator complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone demethylation • ремоделювання хроматину • peptidyl-arginine hydroxylation • histone H3-K4 demethylation • ribosome biogenesis • histone H3-K36 demethylation • negative regulation of nucleic acid-templated transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84864	67014
Ensembl	ENSG00000170854	ENSMUSG00000022724
UniProt	Q8IUF8	Q8CD15
RefSeq (мРНК)	NM_001042533 NM_001261829 NM_032778 NM_153182	NM_025910
RefSeq (білок)	NP_001035998 NP_001248758 NP_116167 NP_694822	NP_080186
Локус (UCSC)	Хр. 3: 97.94 – 97.97 Mb	Хр. 16: 59.29 – 59.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RIOX2 (англ. Ribosomal oxygenase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 52 800.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPKKAKPTGS		GKEEGPAPCK		QMKLEAAGGP		SALNFDSPSS		LFESLISPIK
TETFFKEFWE		QKPLLIQRDD		PALATYYGSL		FKLTDLKSLC		SRGMYYGRDV
NVCRCVNGKK		KVLNKDGKAH		FLQLRKDFDQ		KRATIQFHQP		QRFKDELWRI
QEKLECYFGS		LVGSNVYITP		AGSQGLPPHY		DDVEVFILQL		EGEKHWRLYH
PTVPLAREYS		VEAEERIGRP		VHEFMLKPGD		LLYFPRGTIH		QADTPAGLAH
STHVTISTYQ		NNSWGDFLLD		TISGLVFDTA		KEDVELRTGI		PRQLLLQVES
TTVATRRLSG		FLRTLADRLE		GTKELLSSDM		KKDFIMHRLP		PYSAGDGAEL
STPGGKLPRL		DSVVRLQFKD		HIVLTVLPDQ		DQSDEAQEKM		VYIYHSLKNS
RETHMMGNEE		ETEFHGLRFP		LSHLDALKQI		WNSPAISVKD		LKLTTDEEKE
SLVLSLWTEC		LIQVV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, біогенез рибосом, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у ядрі.

Література

• Tsuneoka M., Koda Y., Soejima M., Teye K., Kimura H. (2002). A novel myc target gene, mina53, that is involved in cell proliferation. J. Biol. Chem. 277: 35450—35459. PMID 12091391 DOI:10.1074/jbc.M204458200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Eilbracht J., Kneissel S., Hofmann A., Schmidt-Zachmann M.S. (2005). Protein NO52 -- a constitutive nucleolar component sharing high sequence homologies to protein NO66. Eur. J. Cell Biol. 84: 279—294. PMID 15819408 DOI:10.1016/j.ejcb.2004.12.022

Див. також

• Хромосома 3