RRP1B

RRP1B
Ідентифікатори
Символи	RRP1B, KIAA0179, NNP1L, Nnp1, PPP1R136, RRP1, ribosomal RNA processing 1B
Зовнішні ІД	OMIM: 610654 MGI: 1919712 HomoloGene: 57086 GeneCards: RRP1B
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • GO:0035328 Гетерохроматин • preribosome, small subunit precursor • гіалоплазма • GO:0035327 Еухроматин • ядерце • клітинне ядро • preribosome, large subunit precursor • granular component • нуклеоплазма • хромосома Біологічний процес • negative regulation of phosphatase activity • rRNA processing • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity • positive regulation of apoptotic process • regulation of RNA splicing • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to virus • mRNA processing • GO:0097285 апоптоз • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23076	72462
Ensembl	ENSG00000160208	ENSMUSG00000058392
UniProt	Q14684	Q91YK2
RefSeq (мРНК)	NM_015056	NM_001163734 NM_028244
RefSeq (білок)	NP_055871	NP_001157206 NP_082520
Локус (UCSC)	Хр. 21: 43.66 – 43.7 Mb	Хр. 17: 32.26 – 32.28 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RRP1B (англ. Ribosomal RNA processing 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 758 амінокислот, а молекулярна маса — 84 428.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPAMQPAEI		QFAQRLASSE		KGIRDRAVKK		LRQYISVKTQ		RETGGFSQEE
LLKIWKGLFY		CMWVQDEPLL		QEELANTIAQ		LVHAVNNSAA		QHLFIQTFWQ
TMNREWKGID		RLRLDKYYML		IRLVLRQSFE		VLKRNGWEES		RIKVFLDVLM
KEVLCPESQS		PNGVRFHFID		IYLDELSKVG		GKELLADQNL		KFIDPFCKIA
AKTKDHTLVQ		TIARGVFEAI		VDQSPFVPEE		TMEEQKTKVG		DGDLSAEEIP
ENEVSLRRAV		SKKKTALGKN		HSRKDGLSDE		RGRDDCGTFE		DTGPLLQFDY
KAVADRLLEM		TSRKNTPHFN		RKRLSKLIKK		FQDLSEGSSI		SQLSFAEDIS
ADEDDQILSQ		GKHKKKGNKL		LEKTNLEKEK		GSRVFCVEEE		DSESSLQKRR
RKKKKKHHLQ		PENPGPGGAA		PSLEQNRGRE		PEASGLKALK		ARVAEPGAEA
TSSTGEESGS		EHPPAVPMHN		KRKRPRKKSP		RAHREMLESA		VLPPEDMSQS
GPSGSHPQGP		RGSPTGGAQL		LKRKRKLGVV		PVNGSGLSTP		AWPPLQQEGP
PTGPAEGANS		HTTLPQRRRL		QKKKAGPGSL		ELCGLPSQKT		ASLKKRKKMR
VMSNLVEHNG		VLESEAGQPQ		ALGSSGTCSS		LKKQKLRAES		DFVKFDTPFL
PKPLFFRRAK		SSTATHPPGP		AVQLNKTPSS		SKKVTFGLNR		NMTAEFKKTD
KSILVSPTGP		SRVAFDPEQK		PLHGVLKTPT		SSPASSPLVA		KKPLTTTPRR
RPRAMDFF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 21