RUVBL1

RUVBL1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2C9O, 2XSZ
Ідентифікатори
Символи	RUVBL1, ECP54, INO80H, NMP238, PONTIN, Pontin52, RVB1, TIH1, TIP49, TIP49A, ECP-54, NMP 238, RuvB like AAA ATPase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603449 MGI: 1928760 HomoloGene: 37839 GeneCards: RUVBL1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • GO:0043141 5'-3' DNA helicase activity; • GO:0008026 helicase activity; • GO:0004003 DNA helicase activity; • ATPase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • ATP binding; • cadherin binding; • TFIID-class transcription factor complex binding; • ADP binding; • ATPase binding;
Клітинна компонента	• мембрана; • nuclear matrix; • NuA4 histone acetyltransferase complex; • нуклеоплазма; • центр організації мікротрубочок; • MLL1 complex; • екзосома; • цитоскелет; • клітинне ядро; • Swr1 complex; • R2TP complex; • цитоплазма; • гіалоплазма; • Ino80 complex;
Біологічний процес	• DNA recombination; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • positive regulation of protein targeting to mitochondrion; • histone H2A acetylation; • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0061641 CENP-A containing chromatin assembly; • transcription, DNA-templated; • cellular response to DNA damage stimulus; • поділ клітини; • regulation of autophagy of mitochondrion; • Сперматогенез; • positive regulation of telomerase RNA localization to Cajal body; • histone H4 acetylation; • клітинний цикл; • regulation of growth; • beta-catenin-TCF complex assembly; • DNA duplex unwinding; • protein deubiquitination; • GO:0100026 Репарація ДНК; • box C/D snoRNP assembly; • ремоделювання хроматину;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	8607
	56505
	ENSG00000175792; ENSG00000284901
	ENSMUSG00000030079
	Q9Y265
	P60122
	NM_003707; NM_001319084; NM_001319086
	NM_019685
	NP_001306013; NP_001306015; NP_003698
	NP_062659
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RUVBL1 (англ. RuvB like AAA ATPase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 456 амінокислот, а молекулярна маса — 50 228^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKIEEVKSTT	KTQRIASHSH	VKGLGLDESG	LAKQAASGLV	GQENAREACG
VIVELIKSKK	MAGRAVLLAG	PPGTGKTALA	LAIAQELGSK	VPFCPMVGSE
VYSTEIKKTE	VLMENFRRAI	GLRIKETKEV	YEGEVTELTP	CETENPMGGY
GKTISHVIIG	LKTAKGTKQL	KLDPSIFESL	QKERVEAGDV	IYIEANSGAV
KRQGRCDTYA	TEFDLEAEEY	VPLPKGDVHK	KKEIIQDVTL	HDLDVANARP
QGGQDILSMM	GQLMKPKKTE	ITDKLRGEIN	KVVNKYIDQG	IAELVPGVLF
VDEVHMLDIE	CFTYLHRALE	SSIAPIVIFA	SNRGNCVIRG	TEDITSPHGI
PLDLLDRVMI	IRTMLYTPQE	MKQIIKIRAQ	TEGINISEEA	LNHLGEIGTK
TTLRYSVQLL	TPANLLAKIN	GKDSIEKEHV	EEISELFYDA	KSSAKILADQ
QDKYMK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, активаторів, геліказ, регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, клітинний цикл, поділ клітини, пошкодження ДНК, репарація ДНК, мітоз, рекомбінація ДНК, регуляція росту. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані.

Література[ред. | ред. код]

Bauer A., Huber O., Kemler R. (1998). Pontin52, an interaction partner of beta-catenin, binds to the TATA box binding protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 14787—14792. PMID 9843967 DOI:10.1073/pnas.95.25.14787
Salzer U., Kubicek M., Prohaska R. (1999). Isolation, molecular characterization, and tissue-specific expression of ECP-51 and ECP-54 (TIP49), two homologous, interacting erythroid cytosolic proteins. Biochim. Biophys. Acta. 1446: 365—370. PMID 10524211 DOI:10.1016/S0167-4781(99)00104-9
Hawley S.B., Tamura T.-A., Miles L.A. (2001). Purification, cloning, and characterization of a profibrinolytic plasminogen-binding protein, TIP49a. J. Biol. Chem. 276: 179—186. PMID 11027681 DOI:10.1074/jbc.M004919200
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wood M.A., McMahon S.B., Cole M.D. (2000). An ATPase/helicase complex is an essential cofactor for oncogenic transformation by c-Myc. Mol. Cell. 5: 321—330. PMID 10882073 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80427-X
Park J., Wood M.A., Cole M.D. (2002). BAF53 forms distinct nuclear complexes and functions as a critical c-Myc-interacting nuclear cofactor for oncogenic transformation. Mol. Cell. Biol. 22: 1307—1316. PMID 11839798 DOI:10.1128/MCB.22.5.1307-1316.2002