SEMA3A

SEMA3A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1Q47, 4GZ8, 4GZA
Ідентифікатори
Символи	SEMA3A, COLL1, HH16, Hsema-I, Hsema-III, SEMA1, SEMAD, SEMAIII, SEMAL, SemD, coll-1, semaphorin 3A
Зовнішні ІД	OMIM: 603961 MGI: 107558 HomoloGene: 31358 GeneCards: SEMA3A
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння, пріонні хвороби, розлад дефіциту уваги та гіперактивності, hypogonadotropic hypogonadism 16 with or without anosmia
Онтологія гена Молекулярна функція • chemorepellent activity • semaphorin receptor binding • neuropilin binding Клітинна компонента • extracellular region • дендрит (нейробіологія) • міжклітинний простір • аксон • integral component of plasma membrane Біологічний процес • sympathetic ganglion development • negative regulation of axon extension • диференціація клітин • ventral trunk neural crest cell migration • regulation of axon extension involved in axon guidance • semaphorin-plexin signaling pathway involved in neuron projection guidance • negative chemotaxis • neural crest cell migration involved in sympathetic nervous system development • sympathetic nervous system development • facioacoustic ganglion development • dendrite morphogenesis • trigeminal ganglion development • neuron migration • semaphorin-plexin signaling pathway involved in axon guidance • регуляція серцевого ритму • нейробіологія розвитку • axon guidance • multicellular organism development • sympathetic neuron projection guidance • neural crest cell migration involved in autonomic nervous system development • branchiomotor neuron axon guidance • gonadotrophin-releasing hormone neuronal migration to the hypothalamus • axonogenesis involved in innervation • dichotomous subdivision of terminal units involved in salivary gland branching • facial nerve structural organization • olfactory bulb development • motor neuron axon guidance • axonal fasciculation • negative regulation of epithelial cell migration • nerve development • trigeminal nerve structural organization • axon extension involved in axon guidance • semaphorin-plexin signaling pathway • sympathetic neuron projection extension • positive regulation of male gonad development • sensory system development • GO:0097285 апоптоз • negative regulation of neuron projection development • negative regulation of axon extension involved in axon guidance • positive regulation of neuron migration • neural crest cell migration • positive regulation of cell migration • positive regulation of JNK cascade • basal dendrite arborization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10371	20346
Ensembl	ENSG00000075213	ENSMUSG00000028883
UniProt	Q14563	O08665
RefSeq (мРНК)	NM_006080	NM_001243072 NM_001243073 NM_009152
RefSeq (білок)	NP_006071	NP_001230001 NP_001230002 NP_033178
Локус (UCSC)	Хр. 7: 83.96 – 84.49 Mb	Хр. 5: 13.18 – 13.65 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SEMA3A (англ. Semaphorin 3A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 771 амінокислот, а молекулярна маса — 88 889.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGWLTRIVCL		FWGVLLTARA		NYQNGKNNVP		RLKLSYKEML		ESNNVITFNG
LANSSSYHTF		LLDEERSRLY		VGAKDHIFSF		DLVNIKDFQK		IVWPVSYTRR
DECKWAGKDI		LKECANFIKV		LKAYNQTHLY		ACGTGAFHPI		CTYIEIGHHP
EDNIFKLENS		HFENGRGKSP		YDPKLLTASL		LIDGELYSGT		AADFMGRDFA
IFRTLGHHHP		IRTEQHDSRW		LNDPKFISAH		LISESDNPED		DKVYFFFREN
AIDGEHSGKA		THARIGQICK		NDFGGHRSLV		NKWTTFLKAR		LICSVPGPNG
IDTHFDELQD		VFLMNFKDPK		NPVVYGVFTT		SSNIFKGSAV		CMYSMSDVRR
VFLGPYAHRD		GPNYQWVPYQ		GRVPYPRPGT		CPSKTFGGFD		STKDLPDDVI
TFARSHPAMY		NPVFPMNNRP		IVIKTDVNYQ		FTQIVVDRVD		AEDGQYDVMF
IGTDVGTVLK		VVSIPKETWY		DLEEVLLEEM		TVFREPTAIS		AMELSTKQQQ
LYIGSTAGVA		QLPLHRCDIY		GKACAECCLA		RDPYCAWDGS		ACSRYFPTAK
RRTRRQDIRN		GDPLTHCSDL		HHDNHHGHSP		EERIIYGVEN		SSTFLECSPK
SQRALVYWQF		QRRNEERKEE		IRVDDHIIRT		DQGLLLRSLQ		QKDSGNYLCH
AVEHGFIQTL		LKVTLEVIDT		EHLEELLHKD		DDGDGSKTKE		MSNSMTPSQK
VWYRDFMQLI		NHPNLNTMDE		FCEQVWKRDR		KQRRQRPGHT		PGNSNKWKHL
QENKKGRNRR		THEFERAPRS		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, нейрогенез. Секретований назовні.

Література

• Kolodkin A.L., Matthes D.J., Goodman C.S. (1993). The semaphorin genes encode a family of transmembrane and secreted growth cone guidance molecules. Cell. 75: 1389—1399. PMID 8269517 DOI:10.1016/0092-8674(93)90625-Z

Див. також

• Хромосома 7