USP42

USP42
Ідентифікатори
Символи	USP42, ubiquitin specific peptidase 42
Зовнішні ІД	MGI: 1924050 HomoloGene: 35425 GeneCards: USP42
Онтологія гена Молекулярна функція • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase • cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • нуклеоплазма Біологічний процес • ubiquitin-dependent protein catabolic process • Сперматогенез • протеоліз • диференціація клітин • protein deubiquitination • regulation of apoptotic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84132	76800
Ensembl	ENSG00000106346	ENSMUSG00000051306
UniProt	Q9H9J4	B2RQC2
RefSeq (мРНК)	NM_032172 NM_001365764 NM_001389650	NM_029749
RefSeq (білок)	NP_115548 NP_001352693	NP_084025
Локус (UCSC)	Хр. 7: 6.1 – 6.16 Mb	Хр. 5: 143.7 – 143.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP42 (англ. Ubiquitin specific peptidase 42) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 324 амінокислот, а молекулярна маса — 145 392.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTIVDKASES		SDPSAYQNQP		GSSEAVSPGD		MDAGSASWGA		VSSLNDVSNH
TLSLGPVPGA		VVYSSSSVPD		KSKPSPQKDQ		ALGDGIAPPQ		KVLFPSEKIC
LKWQQTHRVG		AGLQNLGNTC		FANAALQCLT		YTPPLANYML		SHEHSKTCHA
EGFCMMCTMQ		AHITQALSNP		GDVIKPMFVI		NEMRRIARHF		RFGNQEDAHE
FLQYTVDAMQ		KACLNGSNKL		DRHTQATTLV		CQIFGGYLRS		RVKCLNCKGV
SDTFDPYLDI		TLEIKAAQSV		NKALEQFVKP		EQLDGENSYK		CSKCKKMVPA
SKRFTIHRSS		NVLTLSLKRF		ANFTGGKIAK		DVKYPEYLDI		RPYMSQPNGE
PIVYVLYAVL		VHTGFNCHAG		HYFCYIKASN		GLWYQMNDSI		VSTSDIRSVL
SQQAYVLFYI		RSHDVKNGGE		LTHPTHSPGQ		SSPRPVISQR		VVTNKQAAPG
FIGPQLPSHM		IKNPPHLNGT		GPLKDTPSSS		MSSPNGNSSV		NRASPVNASA
SVQNWSVNRS		SVIPEHPKKQ		KITISIHNKL		PVRQCQSQPN		LHSNSLENPT
KPVPSSTITN		SAVQSTSNAS		TMSVSSKVTK		PIPRSESCSQ		PVMNGKSKLN
SSVLVPYGAE		SSEDSDEESK		GLGKENGIGT		IVSSHSPGQD		AEDEEATPHE
LQEPMTLNGA		NSADSDSDPK		ENGLAPDGAS		CQGQPALHSE		NPFAKANGLP
GKLMPAPLLS		LPEDKILETF		RLSNKLKGST		DEMSAPGAER		GPPEDRDAEP
QPGSPAAESL		EEPDAAAGLS		STKKAPPPRD		PGTPATKEGA		WEAMAVAPEE
PPPSAGEDIV		GDTAPPDLCD		PGSLTGDASP		LSQDAKGMIA		EGPRDSALAE
APEGLSPAPP		ARSEEPCEQP		LLVHPSGDHA		RDAQDPSQSL		GAPEAAERPP
APVLDMAPAG		HPEGDAEPSP		GERVEDAAAP		KAPGPSPAKE		KIGSLRKVDR
GHYRSRRERS		SSGEPARESR		SKTEGHRHRR		RRTCPRERDR		QDRHAPEHHP
GHGDRLSPGE		RRSLGRCSHH		HSRHRSGVEL		DWVRHHYTEG		ERGWGREKFY
PDRPRWDRCR		YYHDRYALYA		ARDWKPFHGG		REHERAGLHE		RPHKDHNRGR
RGCEPARERE		RHRPSSPRAG		APHALAPHPD		RFSHDRTALV		AGDNCNLSDR
FHEHENGKSR		KRRHDSVENS		DSHVEKKARR		SEQKDPLEEP		KAKKHKKSKK
KKKSKDKHRD		RDSRHQQDSD		LSAACSDADL		HRHKKKKKKK		KRHSRKSEDF
VKDSELHLPR		VTSLETVAQF		RRAQGGFPLS		GGPPLEGVGP		FREKTKHLRM
ESRDDRCRLF		EYGQGKRRYL		ELGR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, диференціація клітин, сперматогенез, альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 7