Каспаза-12

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
CASP12
Ідентифікатори
Символи CASP12, CASP-12, CASP12P1, caspase 12 (gene/pseudogene)
Зовнішні ІД OMIM: 608633 GeneCards: CASP12
Реагує на сполуку
emricasan[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001191016
н/д
RefSeq (білок)
NP_001177945
н/д
Локус (UCSC) Хр. 11: 104.89 – 104.9 Mb н/д
PubMed search [2] н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

Каспаза 12(CASP12) - білок сімейства каспаз, кодується геном CASP12, що у людей знаходиться на довгому плечі 11-ї хромосоми. Структурно білок найбільш схожий на сімейство каспаз ICE(англ. Interleukin 1-beta Converting Enzyme, ICE — фермети, що конвертують інтерлейкін 1-бета). На відмінну від інших каспаз, не має протеазної активності.

У щурів, гомологічний білок є медіатором апоптозу у відповідь на пошкодження ендоплазматичного ретикулуму(ЕПР-стрес).

Людський ген CASP12 має дуже поширений поліморфізм, при якому в гені присутній передчасний стоп-кодон. Тому у більшості людей транслюється нефункціональний білок. Функціональний білок синтезується в людей, що належать до певної етнічної групи африканських аборигенів, в яких виявлений підвищений ризик розвитку сепсису.

Виявлено кілька різних форм транскрипту, що утворюються шляхами альтернативного сплайсингу.

Ген CASP12[ред. | ред. код]

Ген CASP12 є білок-кодуючим і розташований на довгому плечі 11-ї хромосоми. Складається з 12 953-ох нуклеотидів.

Ген та його продукти задіяні в розвитку аміотрофічного латерального склерозу, транспорті електронів в дихальних шляхах та в синтезі АТФ. Бере участь в механізмах апоптозу.

Важливим паралогом гену є ген CASP4.

Біохімічні процеси, в які задіяні продукти гену[ред. | ред. код]

Фізіологічні процеси:

Патологічні процеси:

Білок[ред. | ред. код]

Білок має 3 ізоформи, створені шляхом альтернативного сплайсингу. Найпоширеніша ізоформа 1(Q6UXS9-1)складається з 341-ї амінокислоти та має молекулярну масу в 38,9 кДа. Ізоформа 2 (Q6UXS9-2) має стоп-кодон на місці 169-ї амінокислоти, тому її довжина 168 амінокислот та молекулярна маса 19 кДа. Крім цього, після 87-ї амінокислоти спостерігаються амінокислотні заміни. В ізоформі 3(Q6UXS9-3) відсутній фрагмент з 3-86 амінокислот, довжина - 257, молекулярна маса - 29,4 кДа.

Найбільша концентрація білку виявлена в ЕПР, невелика кількість присутня в цитозолі.

Білок може знижувати вивільнення цитокінів у відповідь на бактеріальний ліпополісахарид під час інфекцій. Знижує активацію NF-каппа-B у відповідь на TNF.

Недавні дослідження показали, що відбувається позитивний добір індивідів за неактивною формою гену, так як вони більш стійкі до розвитку запальних захворювань.

Література[ред. | ред. код]

  1. Population distribution of the functional caspase-12 allele. (PMID: 16917906) Kachapati K … Dean M Human mutation 2006[3]
  2. Spread of an inactive form of caspase-12 in humans is due to recent positive selection. (PMID: 16532395) Xue Y … Tyler-Smith C American journal of human genetics 2006
  3. Human caspase 12 has acquired deleterious mutations. (PMID: 12054529) Fischer H … Tschachler E Biochemical and biophysical research communications 2002[4]
  4. Genetic variation of innate immune genes in HIV-infected african patients with or without oropharyngeal candidiasis.[5] (PMID: 20577092) Plantinga TS … Netea MG Journal of acquired immune deficiency syndromes (1999) 2010
  5. Persistence of full-length caspase-12 and its relation to malaria in West and Central African populations. (PMID: 20423816) McCall MB … Netea MG European cytokine network 2010

Див. також[ред. | ред. код]

Примітки[ред. | ред. код]

  1. Сполуки, які фізично взаємодіють з Caspase 12 (gene/pseudogene) переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Kachapati, Kritika; O'Brien, Thomas R.; Bergeron, Julie; Zhang, Mingdong; Dean, Michael (2006-9). Population distribution of the functional caspase-12 allele. Human Mutation. Т. 27, № 9. с. 975. doi:10.1002/humu.9448. ISSN 1098-1004. PMID 16917906. Архів оригіналу за 10 січня 2019. Процитовано 9 січня 2019.
  4. Fischer, Heinz; Koenig, Ulrich; Eckhart, Leopold; Tschachler, Erwin (3 травня 2002). Human caspase 12 has acquired deleterious mutations. Biochemical and Biophysical Research Communications. Т. 293, № 2. с. 722—726. doi:10.1016/S0006-291X(02)00289-9. ISSN 0006-291X. PMID 12054529. Архів оригіналу за 10 січня 2019. Процитовано 9 січня 2019.
  5. https://web.archive.org/web/20190110014306/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20577092. Архів оригіналу за 10 січня 2019. {{cite web}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)