До основних завдань місії STS−66 належало дослідження стану навколишнього середовища. На Шаттлі була встановлена науково-прикладна лабораторія з вивчення атмосфери ATLAS-03 (англ.Atmospheric Laboratory for Applications and Sciences, 3-й політ лабораторії). Прилади лабораторії провели глобальний вимір температур у мезосфері і концентрацій малих домішок, дослідження взаємодії сонячного випромінювання з окремими хімічними компонентами в термосфері. Важливим доповненням до даних лабораторії послужили результати дослідження нижньої і середньої термосфери приладами відокремлюваного супутника CRISTA — SPAS[2] (від англ.Cryogenic Infrared Spectrometers and Telescopes for the Atmosphere), який здійснив автономний 8-добовий політ.
На емблемі місії STS-66 зображений стартуючий Шаттл«Атлантіс», що стилізовано потрійним шлейфом полум'я під символ корпусу астронавтів НАСА. Зображено також супутник CRISTA — SPAS, що повертається, завдяки якому були проведені спостереження земної атмосфери в променях сонячного світла: від чого висхідне сонце і лінія видимого спектра на горизонтіЗемлі. Розробка емблеми проходила за участю членів екіпажу[3].
(НАСА): Доналд Макмонегл (3)[1] — командир ;
(CNES): Жан-Франсуа Клервуа (1) — фахівець польоту −3 ;
