LNPEP

LNPEP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4PJ6, 4P8Q, 4Z7I, 5C97
Ідентифікатори
Символи	LNPEP, CAP, IRAP, P-LAP, PLAP, leucyl/cystinyl aminopeptidase, leucyl and cystinyl aminopeptidase
Зовнішні ІД	OMIM: 151300 MGI: 2387123 HomoloGene: 21148 GeneCards: LNPEP
Онтологія гена Молекулярна функція • пептидний зв'язок • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • aminopeptidase activity • metallopeptidase activity • metalloaminopeptidase activity • hydrolase activity • zinc ion binding Клітинна компонента • integral component of membrane • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • внутрішньоклітинний • extracellular region • lysosomal membrane • perinuclear region of cytoplasm • early endosome lumen • cytoplasmic vesicle membrane Біологічний процес • SMAD protein signal transduction • жіноча вагітність • cell-cell signaling • protein polyubiquitination • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent • протеоліз • regulation of blood pressure • GO:0044257 protein catabolic process • membrane organization • GO:0072468 сигнальна трансдукція • peptide catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4012	240028
Ensembl	ENSG00000113441	ENSMUSG00000023845
UniProt	Q9UIQ6	Q8C129
RefSeq (мРНК)	NM_175920 NM_005575	NM_172827
RefSeq (білок)	NP_005566 NP_787116	NP_766415
Локус (UCSC)	Хр. 5: 96.94 – 97.04 Mb	Хр. 17: 17.74 – 17.85 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LNPEP (англ. Leucyl and cystinyl aminopeptidase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 025 амінокислот, а молекулярна маса — 117 349.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEPFTNDRLQ		LPRNMIENSM		FEEEPDVVDL		AKEPCLHPLE		PDEVEYEPRG
SRLLVRGLGE		HEMEEDEEDY		ESSAKLLGMS		FMNRSSGLRN		SATGYRQSPD
GACSVPSART		MVVCAFVIVV		AVSVIMVIYL		LPRCTFTKEG		CHKKNQSIGL
IQPFATNGKL		FPWAQIRLPT		AVVPLRYELS		LHPNLTSMTF		RGSVTISVQA
LQVTWNIILH		STGHNISRVT		FMSAVSSQEK		QAEILEYAYH		GQIAIVAPEA
LLAGHNYTLK		IEYSANISSS		YYGFYGFSYT		DESNEKKYFA		ATQFEPLAAR
SAFPCFDEPA		FKATFIIKII		RDEQYTALSN		MPKKSSVVLD		DGLVQDEFSE
SVKMSTYLVA		FIVGEMKNLS		QDVNGTLVSI		YAVPEKIGQV		HYALETTVKL
LEFFQNYFEI		QYPLKKLDLV		AIPDFEAGAM		ENWGLLTFRE		ETLLYDSNTS
SMADRKLVTK		IIAHELAHQW		FGNLVTMKWW		NDLWLNEGFA		TFMEYFSLEK
IFKELSSYED		FLDARFKTMK		KDSLNSSHPI		SSSVQSSEQI		EEMFDSLSYF
KGSSLLLMLK		TYLSEDVFQH		AVVLYLHNHS		YASIQSDDLW		DSFNEVTNQT
LDVKRMMKTW		TLQKGFPLVT		VQKKGKELFI		QQERFFLNMK		PEIQPSDTSY
LWHIPLSYVT		EGRNYSKYQS		VSLLDKKSGV		INLTEEVLWV		KVNINMNGYY
IVHYADDDWE		ALIHQLKINP		YVLSDKDRAN		LINNIFELAG		LGKVPLKRAF
DLINYLGNEN		HTAPITEALF		QTDLIYNLLE		KLGYMDLASR		LVTRVFKLLQ
NQIQQQTWTD		EGTPSMRELR		SALLEFACTH		NLGNCSTTAM		KLFDDWMASN
GTQSLPTDVM		TTVFKVGAKT		DKGWSFLLGK		YISIGSEAEK		NKILEALASS
EDVRKLYWLM		KSSLNGDNFR		TQKLSFIIRT		VGRHFPGHLL		AWDFVKENWN
KLVQKFPLGS		YTIQNIVAGS		TYLFSTKTHL		SEVQAFFENQ		SEATFRLRCV
QEALEVIQLN		IQWMEKNLKS		LTWWL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, амінопептидаз, металопротеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Rogi T., Tsujimoto M., Nakazato H., Mizutani S., Tomoda Y. (1996). Human placental leucine aminopeptidase/oxytocinase. A new member of type II membrane-spanning zinc metallopeptidase family. J. Biol. Chem. 271: 56—61. PMID 8550619 DOI:10.1074/jbc.271.1.56
• Falk K., Roetzschke O., Stevanovic S., Jung G., Rammensee H.G. (1994). Pool sequencing of natural HLA-DR, DQ, and DP ligands reveals detailed peptide motifs, constraints of processing, and general rules. Immunogenetics. 39: 230—242. PMID 8119729 DOI:10.1007/BF00188785

Див. також

• Хромосома 5