PTBP3

PTBP3
Ідентифікатори
Символи	PTBP3, ROD1, polypyrimidine tract binding protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 607527 MGI: 1923334 HomoloGene: 55872 GeneCards: PTBP3
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • anatomical structure morphogenesis • mRNA processing • диференціація клітин • negative regulation of RNA splicing • Сплайсинг РНК • erythrocyte maturation • регуляція диференціювання клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9991	230257
Ensembl	ENSG00000119314	ENSMUSG00000028382
UniProt	O95758	Q8BHD7
RefSeq (мРНК)	NM_001163788 NM_001163790 NM_001244896 NM_001244897 NM_001244898 NM_005156 NM_001375918 NM_001375920	NM_144904 NM_178164
RefSeq (білок)	NP_001157260 NP_001157262 NP_001231825 NP_001231826 NP_001231827 NP_005147 NP_001362847 NP_001362849	NP_659153 NP_835458 NP_001391362 NP_001391363 NP_001391364 NP_001391365 NP_001391366 NP_001391367 NP_001391368 NP_001391369
Локус (UCSC)	Хр. 9: 112.22 – 112.33 Mb	Хр. 4: 59.47 – 59.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTBP3 (англ. Polypyrimidine tract binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 9-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 552 амінокислот, а молекулярна маса — 59 690.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDGVVTDLIT		VGLKRGSDEL		LSSGIINGPF		TMNSSTPSTA		NGNDSKKFKR
DRPPCSPSRV		LHLRKIPCDV		TEAEIISLGL		PFGKVTNLLM		LKGKSQAFLE
MASEEAAVTM		VNYYTPITPH		LRSQPVYIQY		SNHRELKTDN		LPNQARAQAA
LQAVSAVQSG		SLALSGGPSN		EGTVLPGQSP		VLRIIIENLF		YPVTLEVLHQ
IFSKFGTVLK		IITFTKNNQF		QALLQYADPV		NAHYAKMALD		GQNIYNACCT
LRIDFSKLTS		LNVKYNNDKS		RDFTRLDLPT		GDGQPSLEPP		MAAAFGAPGI
ISSPYAGAAG		FAPAIGFPQA		TGLSVPAVPG		ALGPLTITSS		AVTGRMAIPG
ASGIPGNSVL		LVTNLNPDLI		TPHGLFILFG		VYGDVHRVKI		MFNKKENALV
QMADANQAQL		AMNHLSGQRL		YGKVLRATLS		KHQAVQLPRE		GQEDQGLTKD
FSNSPLHRFK		KPGSKNFQNI		FPPSATLHLS		NIPPSVTVDD		LKNLFIEAGC
SVKAFKFFQK		DRKMALIQLG		SVEEAIQALI		ELHNHDLGEN		HHLRVSFSKS
TI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, диференціація клітин, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yamamoto H., Tsukahara K., Kanaoka Y., Jinno S., Okayama H. (1999). Isolation of a mammalian homologue of a fission yeast differentiation regulator. Mol. Cell. Biol. 19: 3829—3841. PMID 10207106 DOI:10.1128/MCB.19.5.3829
• Robinson F., Jackson R.J., Smith C.W. (2008). Expression of human nPTB is limited by extreme suboptimal codon content. PLoS ONE. 3: E1801—E1801. PMID 18335065 DOI:10.1371/journal.pone.0001801
• Sadvakassova G., Dobocan M.C., Difalco M.R., Congote L.F. (2009). Regulator of differentiation 1 (ROD1) binds to the amphipathic C-terminal peptide of thrombospondin-4 and is involved in its mitogenic activity. J. Cell. Physiol. 220: 672—679. PMID 19441079 DOI:10.1002/jcp.21817

Див. також

• Хромосома 9