ACKR3: відмінності між версіями

ACKR3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	7SK6, 7SK5
Ідентифікатори
Символи	ACKR3, CMKOR1, CXC-R7, CXCR-7, CXCR7, GPR159, RDC-1, RDC1, atypical chemokine receptor 3
Зовнішні ІД	OMIM: 610376 MGI: 109562 HomoloGene: 22419 GeneCards: ACKR3
Реагує на сполуку
	plerixafor
Онтологія гена
Молекулярна функція	• C-X-C chemokine receptor activity; • G protein-coupled receptor activity; • coreceptor activity; • C-X-C chemokine binding; • signal transducer activity; • chemokine binding; • scavenger receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • C-C chemokine receptor activity; • C-C chemokine binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • recycling endosome; • ендосома; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • мембрана; • клітинна мембрана; • cell surface; • early endosome; • perinuclear region of cytoplasm; • clathrin-coated pit; • клітинне ядро; • external side of plasma membrane;
Біологічний процес	• chemokine-mediated signaling pathway; • receptor internalization; • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage; • васкулогенез; • multicellular organism development; • хемотаксис; • адгезія клітин; • Ангіогенез; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • GO:0022415 viral process; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • positive regulation of mesenchymal stem cell migration; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • calcium-mediated signaling; • cell chemotaxis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	57007
	12778
	ENSG00000144476
	ENSMUSG00000044337
	P25106
	P56485
	NM_001047841; NM_020311
	NM_001271607; NM_007722
	NP_064707
	NP_001258536; NP_031748
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Наступне редагування →

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Версія за 16:12, 29 серпня 2017

ACKR3 (англ. Atypical chemokine receptor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 362 амінокислот, а молекулярна маса — 41 493^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M D L H L F D Y S E	P G N F S D I S W P	C N S S D C I V V D	T V M C P N M P N K	S V L L Y T L S F I
Y I F I F V I G M I	A N S V V V W V N I	Q A K T T G Y D T H	C Y I L N L A I A D	L W V V L T I P V W
V V S L V Q H N Q W	P M G E L T C K V T	H L I F S I N L F G	S I F F L T C M S V	D R Y L S I T Y F T
N T P S S R K K M V	R R V V C I L V W L	L A F C V S L P D T	Y Y L K T V T S A S	N N E T Y C R S F Y
P E H S I K E W L I	G M E L V S V V L G	F A V P F S I I A V	F Y F L L A R A I S	A S S D Q E K H S S
R K I I F S Y V V V	F L V C W L P Y H V	A V L L D I F S I L	H Y I P F T C R L E	H A L F T A L H V T
Q C L S L V H C C V	N P V L Y S F I N R	N Y R Y E L M K A F	I F K Y S A K T G L	T K L I D A S R V S
E T E Y S A L E Q S	T K

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сігналінгу, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

Sreedharan S.P., Robichon A., Peterson K.E., Goetzl E.J. (1991). Cloning and expression of the human vasoactive intestinal peptide receptor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 4986—4990. PMID 1675791 DOI:10.1073/pnas.88.11.4986
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Infantino S., Moepps B., Thelen M. (2006). Expression and regulation of the orphan receptor RDC1 and its putative ligand in human dendritic and B cells. J. Immunol. 176: 2197—2207. PMID 16455976 DOI:10.4049/jimmunol.176.4.2197
Levoye A., Balabanian K., Baleux F., Bachelerie F., Lagane B. (2009). CXCR7 heterodimerizes with CXCR4 and regulates CXCL12-mediated G protein signaling. Blood. 113: 6085—6093. PMID 19380869 DOI:10.1182/blood-2008-12-196618
Bonecchi R., Savino B., Borroni E.M., Mantovani A., Locati M. (2010). Chemokine decoy receptors: structure-function and biological properties. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 341: 15—36. PMID 20373092 DOI:10.1007/82_2010_19
Shimizu S., Brown M., Sengupta R., Penfold M.E., Meucci O. (2011). CXCR7 protein expression in human adult brain and differentiated neurons. PLoS ONE. 6: E20680—E20680. PMID 21655198 DOI:10.1371/journal.pone.0020680

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з ACKR3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23692 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.
↑ UniProt, P25106 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з ACKR3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:23692 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.

[UniProt-5] UniProt, P25106 (англ.) . Процитовано 29 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

ACKR3: відмінності між версіями

Версія за 16:12, 29 серпня 2017

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук