ACKR3

ACKR3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 7SK6, 7SK5
Ідентифікатори
Символи	ACKR3, CMKOR1, CXC-R7, CXCR-7, CXCR7, GPR159, RDC-1, RDC1, atypical chemokine receptor 3
Зовнішні ІД	OMIM: 610376 MGI: 109562 HomoloGene: 22419 GeneCards: ACKR3
Реагує на сполуку
plerixafor
Онтологія гена Молекулярна функція • C-X-C chemokine receptor activity • G protein-coupled receptor activity • coreceptor activity • C-X-C chemokine binding • signal transducer activity • chemokine binding • scavenger receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • C-C chemokine receptor activity • C-C chemokine binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • recycling endosome • ендосома • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • клітинна мембрана • cell surface • early endosome • perinuclear region of cytoplasm • clathrin-coated pit • клітинне ядро • external side of plasma membrane Біологічний процес • chemokine-mediated signaling pathway • receptor internalization • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage • васкулогенез • multicellular organism development • хемотаксис • адгезія клітин • Ангіогенез • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • GO:0022415 viral process • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of mesenchymal stem cell migration • G protein-coupled receptor signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • calcium-mediated signaling • cell chemotaxis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57007	12778
Ensembl	ENSG00000144476	ENSMUSG00000044337
UniProt	P25106	P56485
RefSeq (мРНК)	NM_001047841 NM_020311	NM_001271607 NM_007722
RefSeq (білок)	NP_064707	NP_001258536 NP_031748
Локус (UCSC)	Хр. 2: 236.57 – 236.58 Mb	Хр. 1: 90.13 – 90.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ACKR3 (англ. Atypical chemokine receptor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 362 амінокислот, а молекулярна маса — 41 493.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLHLFDYSE		PGNFSDISWP		CNSSDCIVVD		TVMCPNMPNK		SVLLYTLSFI
YIFIFVIGMI		ANSVVVWVNI		QAKTTGYDTH		CYILNLAIAD		LWVVLTIPVW
VVSLVQHNQW		PMGELTCKVT		HLIFSINLFG		SIFFLTCMSV		DRYLSITYFT
NTPSSRKKMV		RRVVCILVWL		LAFCVSLPDT		YYLKTVTSAS		NNETYCRSFY
PEHSIKEWLI		GMELVSVVLG		FAVPFSIIAV		FYFLLARAIS		ASSDQEKHSS
RKIIFSYVVV		FLVCWLPYHV		AVLLDIFSIL		HYIPFTCRLE		HALFTALHVT
QCLSLVHCCV		NPVLYSFINR		NYRYELMKAF		IFKYSAKTGL		TKLIDASRVS
ETEYSALEQS		TK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• Sreedharan S.P., Robichon A., Peterson K.E., Goetzl E.J. (1991). Cloning and expression of the human vasoactive intestinal peptide receptor. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 4986—4990. PMID 1675791 DOI:10.1073/pnas.88.11.4986
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Infantino S., Moepps B., Thelen M. (2006). Expression and regulation of the orphan receptor RDC1 and its putative ligand in human dendritic and B cells. J. Immunol. 176: 2197—2207. PMID 16455976 DOI:10.4049/jimmunol.176.4.2197
• Levoye A., Balabanian K., Baleux F., Bachelerie F., Lagane B. (2009). CXCR7 heterodimerizes with CXCR4 and regulates CXCL12-mediated G protein signaling. Blood. 113: 6085—6093. PMID 19380869 DOI:10.1182/blood-2008-12-196618
• Bonecchi R., Savino B., Borroni E.M., Mantovani A., Locati M. (2010). Chemokine decoy receptors: structure-function and biological properties. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 341: 15—36. PMID 20373092 DOI:10.1007/82_2010_19
• Shimizu S., Brown M., Sengupta R., Penfold M.E., Meucci O. (2011). CXCR7 protein expression in human adult brain and differentiated neurons. PLoS ONE. 6: E20680—E20680. PMID 21655198 DOI:10.1371/journal.pone.0020680

Див. також

• Хромосома 2