CIC: відмінності між версіями

CIC
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2M41, 4J2J, 4J2L
Ідентифікатори
Символи	CIC, capicua transcriptional repressor, MRD45, CIC gene
Зовнішні ІД	OMIM: 612082 MGI: 1918972 HomoloGene: 87637 GeneCards: CIC
Пов'язані генетичні захворювання
	autosomal dominant mental retardation 45
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • chromatin binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific;
Клітинна компонента	• клітинне ядро; • нуклеоплазма; • внутрішньоклітинна мембранна органела; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• transcription, DNA-templated; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • brain development; • навчення; • пам'ять; • соціальна поведінка; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • lung alveolus development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	23152
	71722
	ENSG00000079432
	ENSMUSG00000005442
	Q96RK0
	Q924A2
NM_001304815; NM_015125; NM_001379480; NM_001379482; NM_001379484;
	NM_001379485; NM_001386298
	NM_001110131; NM_001110132; NM_027882; NM_001302811
NP_001291744; NP_055940; NP_001366409; NP_001366411; NP_001366413;
	NP_001366414
	NP_001289740; NP_082158
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Наступне редагування →

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Версія за 10:34, 12 вересня 2017

CIC (англ. Capicua transcriptional repressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 608 амінокислот, а молекулярна маса — 163 820^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M Y S A H R P L M P	A S S A A S R G L G	M F V W T N V E P R	S V A V F P W H S L	V P F L A P S Q P D
P S V Q P S E A Q Q	P A S H P V A S N Q	S K E P A E S A A V	A H E R P P G G T G	S A D P E R P P G A
T C P E S P G P G P	P H P L G V V E S G	K G P P P T T E E E	A S G P P G E P R L	D S E T E S D H D D
A F L S I M S P E I	Q L P L P P G K R R	T Q S L S A L P K E	R D S S S E K D G R	S P N K R E K D H I
R R P M N A F M I F	S K R H R A L V H Q	R H P N Q D N R T V	S K I L G E W W Y A	L G P K E K Q K Y H
D L A F Q V K E A H	F K A H P D W K W C	N K D R K K S S S E	A K P T S L G L A G	G H K E T R E R S M
S E T G T A A A P G	V S S E L L S V A A	Q T L L S S D T K A	P G S S S C G A E R	L H T V G G P G S A
R P R A F S H S G V	H S L D G G E V D S	Q A L Q E L T Q M V	S G P A S Y S G P K	P S T Q Y G A P G P
F A A P G E G G A L	A A T G R P P L L P	T R A S R S Q R A A	S E D M T S D E E R	M V I C E E E G D D
D V I A D D G F G T	T D I D L K C K E R	V T D S E S G D S S	G E D P E G N K G F	G R K V F S P V I R
S S F T H C R P P L	D P E P P G P P D P	P V A F G K G Y G S	A P S S S A S S P A	S S S A S A A T S F
S L G S G T F K A Q	E S G Q G S T A G P	L R P P P P G A G G	P A T P S K A T R F	L P M D P A T F R R
K R P E S V G G L E	P P G P S V I A A P	P S G G G N I L Q T	L V L P P N K E E Q	E G G G A R V P S A
P A P S L A Y G A P	A A P L S R P A A T	M V T N V V R P V S	S T P V P I A S K P	F P T S G R A E A S
P N D T A G A R T E	M G T G S R V P G G	S P L G V S L V Y S	D K K S A A A T S P	A P H L V A G P L L
G T V G K A P A T V	T N L L V G T P G Y	G A P A P P A V Q F	I A Q G A P G G G T	T A G S G A G A G S
G P N G P V P L G I	L Q P G A L G K A G	G I T Q V Q Y I L P	T L P Q Q L Q V A P	A P A P A P G T K A
A A P S G P A P T T	S I R F T L P P G T	S T N G K V L A A T	A P T P G I P I L Q	S V P S A P P P K A
Q S V S P V Q A P P	P G G S A Q L L P G	K V L V P L A A P S	M S V R G G G A G Q	P L P L V S P P F S
V P V Q N G A Q P P	S K I I Q L T P V P	V S T P S G L V P P	L S P A T L P G P T	S Q P Q K V L L P S
S T R I T Y V Q S A	G G H A L P L G T S	P A S S Q A G T V T	S Y G P T S S V A L	G F T S L G P S G P
A F V Q P L L S A G	Q A P L L A P G Q V	G V S P V P S P Q L	P P A C A A P G G P	V I T A F Y S G S P
A P T S S A P L A Q	P S Q A P P S L V Y	T V A T S T T P P A	A T I L P K G P P A	P A T A T P A P T S
P F P S A T A G S M	T Y S L V A P K A Q	R P S P K A P Q K V	K A A I A S I P V G	S F E A G A S G R P
G P A P R Q P L E P	G P V R E P T A P E	S E L E G Q P T P P	A P P P L P E T W T	P T A R S S P P L P
P P A E E R T S A K	G P E T M A S K F P	S S S S D W R V P G	Q G L E N R G E P P	T P P S P A P A P A
V A P G G S S E S S	S G R A A G D T P E	R K E A A G T G K K	V K V R P P P L K K	T F D S V D N R V L
S E V D F E E R F A	E L P E F R P E E V	L P S P T L Q S L A	T S P R A I L G S Y	R K K R K N S T D L
D S A P E D P T S P	K R K M R R R S S C	S S E P N T P K S A	K C E G D I F T F D	R T G T E A E D V L
G E L E Y D K V P Y	S S L R R T L D Q R	R A L V M Q L F Q D	H G F F P S A Q A T	A A F Q A R Y A D I
F P S K V C L Q L K	I R E V R Q K I M Q	A A T P T E Q P P G	A E A P L P V P P P	T G T A A A P A P T
P S P A G G P D P T	S P S S D S G T A Q	A A P P L P P P P E	S G P G Q P G W E G	A P Q P S P P P P G
P S T A A T G R

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Lee C.-J., Chan W.-I., Scotting P.J. (2005). CIC, a gene involved in cerebellar development and ErbB signaling, is significantly expressed in medulloblastomas. J. Neurooncol. 73: 101—108. PMID 15981098 DOI:10.1007/s11060-004-4598-2

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CIC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14214 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q96RK0 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CIC переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14214 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-5] UniProt, Q96RK0 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

CIC: відмінності між версіями

Версія за 10:34, 12 вересня 2017

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук