RALY: відмінності між версіями

RALY
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WF1
Ідентифікатори
Символи	RALY, HNRPCL2, P542, RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein
Зовнішні ІД	OMIM: 614663 MGI: 97850 HomoloGene: 7216 GeneCards: RALY
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • GO:0001104 transcription coregulator activity; • RNA binding;
Клітинна компонента	• catalytic step 2 spliceosome; • spliceosomal complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• mRNA splicing, via spliceosome; • mRNA processing; • Сплайсинг РНК; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • transcription, DNA-templated; • regulation of nucleic acid-templated transcription; • cholesterol homeostasis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	22913
	19383
	ENSG00000125970
	ENSMUSG00000027593
	Q9UKM9
	Q64012
	NM_007367; NM_016732
	NM_001139511; NM_001139512; NM_001139513; NM_023130
	NP_031393; NP_057951
	NP_001132983; NP_001132984; NP_001132985; NP_075619
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Наступне редагування →

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Версія за 11:45, 12 вересня 2017

RALY (англ. RALY heterogeneous nuclear ribonucleoprotein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 306 амінокислот, а молекулярна маса — 32 463^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
M S L K L Q A S N V	T N K N D P K S I N	S R V F I G N L N T	A L V K K S D V E T	I F S K Y G R V A G
C S V H K G Y A F V	Q Y S N E R H A R A	A V L G E N G R V L	A G Q T L D I N M A	G E P K P D R P K G
L K R A A S A I Y S	G Y I F D Y D Y Y R	D D F Y D R L F D Y	R G R L S P V P V P	R A V P V K R P R V
T V P L V R R V K T	N V P V K L F A R S	T A V T T S S A K I	K L K S S E L Q A I	K T E L T Q I K S N
I D A L L S R L E Q	I A A E Q K A N P D	G K K K G D G G G A	G G G G G G G G S G	G G G S G G G G G G
G S S R P P A P Q E	N T T S E A G L P Q	G E A R T R D D G D	E E G L L T H S E E	E L E H S Q D T D A
D D G A L Q

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

Khrebtukova I., Kuklin A., Woychik R.P., Michaud E.J. (1999). Alternative processing of the human and mouse raly genes. Biochim. Biophys. Acta. 1447: 107—112. PMID 10500250 DOI:10.1016/S0167-4781(99)00126-8
Rhodes G.H., Valbracht J.R., Nguyen M.-D., Vaughan J.H. (1997). The p542 gene encodes an autoantigen that cross-reacts with EBNA-1 of the Epstein Barr virus and which may be a heterogeneous nuclear ribonucleoprotein. J. Autoimmun. 10: 447—454. PMID 9376072 DOI:10.1006/jaut.1997.9996
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
Beranova-Giorgianni S., Zhao Y., Desiderio D.M., Giorgianni F. (2006). Phosphoproteomic analysis of the human pituitary. Pituitary. 9: 109—120. PMID 16807684 DOI:10.1007/s11102-006-8916-x
Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15921 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q9UKM9 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15921 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, Q9UKM9 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

RALY: відмінності між версіями

Версія за 11:45, 12 вересня 2017

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук