Компонент 5 системи комплементу

Компонент 5 системи комплементу
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1CFA, 1KJS, 1XWE, 3CU7, 3HQA, 3HQB, 3KLS, 3KM9, 3PRX, 3PVM, 4A5W, 4E0S, 4P39, 4UU9, 5I5K, 5HCE, 5HCC, 5HCD
Ідентифікатори
Символи	C5, C5D, C5a, C5b, CPAMD4, ECLZB, complement component 5, complement C5
Зовнішні ІД	OMIM: 120900 MGI: 96031 HomoloGene: 20412 GeneCards: C5
Онтологія гена Молекулярна функція • chemokine activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • endopeptidase inhibitor activity • signaling receptor binding Клітинна компонента • extracellular region • екзосома • membrane attack complex • міжклітинний простір Біологічний процес • G protein-coupled receptor signaling pathway • Цитоліз • complement activation, alternative pathway • процес імунної системи • complement activation • response to stress • in utero embryonic development • positive regulation of angiogenesis • хемотаксис • cell surface receptor signaling pathway • complement activation, classical pathway • positive regulation of vascular endothelial growth factor production • inflammatory response • regulation of complement activation • negative regulation of macrophage chemotaxis • negative regulation of endopeptidase activity • вроджений імунітет • cell chemotaxis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	727	15139
Ensembl	ENSG00000106804	ENSMUSG00000026874
UniProt	P01031	P06684
RefSeq (мРНК)	NM_001735 NM_001317163 NM_001317164	NM_010406
RefSeq (білок)	NP_001304092 NP_001304093 NP_001726	NP_034536
Локус (UCSC)	Хр. 9: 120.93 – 121.08 Mb	Хр. 2: 34.87 – 34.95 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Компонент 5 системи комплементу (англ. Complement C5) – білок, який кодується геном C5, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 676 амінокислот, а молекулярна маса — 188 305.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLLGILCFL		IFLGKTWGQE		QTYVISAPKI		FRVGASENIV		IQVYGYTEAF
DATISIKSYP		DKKFSYSSGH		VHLSSENKFQ		NSAILTIQPK		QLPGGQNPVS
YVYLEVVSKH		FSKSKRMPIT		YDNGFLFIHT		DKPVYTPDQS		VKVRVYSLND
DLKPAKRETV		LTFIDPEGSE		VDMVEEIDHI		GIISFPDFKI		PSNPRYGMWT
IKAKYKEDFS		TTGTAYFEVK		EYVLPHFSVS		IEPEYNFIGY		KNFKNFEITI
KARYFYNKVV		TEADVYITFG		IREDLKDDQK		EMMQTAMQNT		MLINGIAQVT
FDSETAVKEL		SYYSLEDLNN		KYLYIAVTVI		ESTGGFSEEA		EIPGIKYVLS
PYKLNLVATP		LFLKPGIPYP		IKVQVKDSLD		QLVGGVPVTL		NAQTIDVNQE
TSDLDPSKSV		TRVDDGVASF		VLNLPSGVTV		LEFNVKTDAP		DLPEENQARE
GYRAIAYSSL		SQSYLYIDWT		DNHKALLVGE		HLNIIVTPKS		PYIDKITHYN
YLILSKGKII		HFGTREKFSD		ASYQSINIPV		TQNMVPSSRL		LVYYIVTGEQ
TAELVSDSVW		LNIEEKCGNQ		LQVHLSPDAD		AYSPGQTVSL		NMATGMDSWV
ALAAVDSAVY		GVQRGAKKPL		ERVFQFLEKS		DLGCGAGGGL		NNANVFHLAG
LTFLTNANAD		DSQENDEPCK		EILRPRRTLQ		KKIEEIAAKY		KHSVVKKCCY
DGACVNNDET		CEQRAARISL		GPRCIKAFTE		CCVVASQLRA		NISHKDMQLG
RLHMKTLLPV		SKPEIRSYFP		ESWLWEVHLV		PRRKQLQFAL		PDSLTTWEIQ
GVGISNTGIC		VADTVKAKVF		KDVFLEMNIP		YSVVRGEQIQ		LKGTVYNYRT
SGMQFCVKMS		AVEGICTSES		PVIDHQGTKS		SKCVRQKVEG		SSSHLVTFTV
LPLEIGLHNI		NFSLETWFGK		EILVKTLRVV		PEGVKRESYS		GVTLDPRGIY
GTISRRKEFP		YRIPLDLVPK		TEIKRILSVK		GLLVGEILSA		VLSQEGINIL
THLPKGSAEA		ELMSVVPVFY		VFHYLETGNH		WNIFHSDPLI		EKQKLKKKLK
EGMLSIMSYR		NADYSYSVWK		GGSASTWLTA		FALRVLGQVN		KYVEQNQNSI
CNSLLWLVEN		YQLDNGSFKE		NSQYQPIKLQ		GTLPVEAREN		SLYLTAFTVI
GIRKAFDICP		LVKIDTALIK		ADNFLLENTL		PAQSTFTLAI		SAYALSLGDK
THPQFRSIVS		ALKREALVKG		NPPIYRFWKD		NLQHKDSSVP		NTGTARMVET
TAYALLTSLN		LKDINYVNPV		IKWLSEEQRY		GGGFYSTQDT		INAIEGLTEY
SLLVKQLRLS		MDIDVSYKHK		GALHNYKMTD		KNFLGRPVEV		LLNDDLIVST
GFGSGLATVH		VTTVVHKTST		SEEVCSFYLK		IDTQDIEASH		YRGYGNSDYK
RIVACASYKP		SREESSSGSS		HAVMDISLPT		GISANEEDLK		ALVEGVDQLF
TDYQIKDGHV		ILQLNSIPSS		DFLCVRFRIF		ELFEVGFLSP		ATFTVYEYHR
PDKQCTMFYS		TSNIKIQKVC		EGAACKCVEA		DCGQMQEELD		LTISAETRKQ
TACKPEIAYA		YKVSITSITV		ENVFVKYKAT		LLDIYKTGEA		VAEKDSEITF
IKKVTCTNAE		LVKGRQYLIM		GKEALQIKYN		FSFRYIYPLD		SLTWIEYWPR
DTTCSSCQAF		LANLDEFAED		IFLNGC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як імунітет, вроджений імунітет, альтернативний шлях активації комплементу, шлях активації комплементу, запальна відповідь, цитоліз. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bohnsack J.F., Mollison K.W., Buko A.M., Ashworth J.C., Hill H.R. (1991). Group B streptococci inactivate complement component C5a by enzymic cleavage at the C-terminus. Biochem. J. 273: 635—640. PMID 1996961 DOI:10.1042/bj2730635
• Zuiderweg E.R.P., Mollison K.W., Henkin J., Carter G.W. (1988). Sequence-specific assignments in the 1H NMR spectrum of the human inflammatory protein C5a. Biochemistry. 27: 3568—3580. PMID 3408713 DOI:10.1021/bi00410a007
• Zuiderweg E.R.P., Nettesheim D.G., Mollison K.W., Carter G.W. (1989). Tertiary structure of human complement component C5a in solution from nuclear magnetic resonance data. Biochemistry. 28: 172—185. PMID 2784981 DOI:10.1021/bi00427a025
• Zuiderweg E.R.P., Fesik S.W. (1989). Heteronuclear three-dimensional NMR spectroscopy of the inflammatory protein C5a. Biochemistry. 28: 2387—2391. PMID 2730871 DOI:10.1021/bi00432a008
• Zhang X., Boyar W., Galakatos N., Gonnella N.C. (1997). Solution structure of a unique C5a semi-synthetic antagonist: implications in receptor binding. Protein Sci. 6: 65—72. PMID 9007977 DOI:10.1002/pro.5560060107

Див. також

• Хромосома 9