ALKBH7

ALKBH7
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4QKB, 4QKD, 4QKF
Ідентифікатори
Символи	ALKBH7, ABH7, SPATA11, UNQ6002, alkB homolog 7
Зовнішні ІД	OMIM: 613305 MGI: 1913650 HomoloGene: 11964 GeneCards: ALKBH7
Онтологія гена Молекулярна функція • oxidoreductase activity • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • мітохондріальний матрикс • мітохондрія Біологічний процес • regulation of mitochondrial membrane permeability involved in programmed necrotic cell death • regulation of lipid storage • GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть • fatty acid metabolic process • cellular response to DNA damage stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84266	66400
Ensembl	ENSG00000125652	ENSMUSG00000002661
UniProt	Q9BT30	Q9D6Z0
RefSeq (мРНК)	NM_032306	NM_025538 NM_027372
RefSeq (білок)	NP_115682	NP_079814 NP_081648
Локус (UCSC)	Хр. 19: 6.37 – 6.38 Mb	Хр. 17: 57.3 – 57.31 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ALKBH7 (англ. AlkB homolog 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 221 амінокислот, а молекулярна маса — 24 516.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGTGLLALR		TLPGPSWVRG		SGPSVLSRLQ		DAAVVRPGFL		STAEEETLSR
ELEPELRRRR		YEYDHWDAAI		HGFRETEKSR		WSEASRAILQ		RVQAAAFGPG
QTLLSSVHVL		DLEARGYIKP		HVDSIKFCGA		TIAGLSLLSP		SVMRLVHTQE
PGEWLELLLE		PGSLYILRGS		ARYDFSHEIL		RDEESFFGER		RIPRGRRISV
ICRSLPEGMG		PGESGQPPPA		C

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном заліза. Локалізований у мітохондрії.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Fu D., Jordan J.J., Samson L.D. (2013). Human ALKBH7 is required for alkylation and oxidation-induced programmed necrosis. Genes Dev. 27: 1089—1100. PMID 23666923 DOI:10.1101/gad.215533.113

Див. також

• Хромосома 19