CAPN11

CAPN11
Ідентифікатори
Символи	CAPN11, calpain11, calpain 11
Зовнішні ІД	OMIM: 604822 MGI: 1352490 HomoloGene: 21392 GeneCards: CAPN11
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • Акросома • внутрішньоклітинний • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • цитоплазма Біологічний процес • протеоліз Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11131	268958
Ensembl	ENSG00000137225	ENSMUSG00000058626
UniProt	Q9UMQ6	Q6J756
RefSeq (мРНК)	NM_007058	NM_001013767
RefSeq (білок)	NP_008989	NP_001013789
Локус (UCSC)	Хр. 6: 44.16 – 44.18 Mb	Хр. 17: 45.94 – 45.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CAPN11 (англ. Calpain 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 739 амінокислот, а молекулярна маса — 84 423.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLYSPGPSLP		ESAESLDGSQ		EDKPRGSCAE		PTFTDTGMVA		HINNSRLKAK
GVGQHDNAQN		FGNQSFEELR		AACLRKGELF		EDPLFPAEPS		SLGFKDLGPN
SKNVQNISWQ		RPKDIINNPL		FIMDGISPTD		ICQGILGDCW		LLAAIGSLTT
CPKLLYRVVP		RGQSFKKNYA		GIFHFQIWQF		GQWVNVVVDD		RLPTKNDKLV
FVHSTERSEF		WSALLEKAYA		KLSGSYEALS		GGSTMEGLED		FTGGVAQSFQ
LQRPPQNLLR		LLRKAVERSS		LMGCSIEVTS		DSELESMTDK		MLVRGHAYSV
TGLQDVHYRG		KMETLIRVRN		PWGRIEWNGA		WSDSAREWEE		VASDIQMQLL
HKTEDGEFWM		SYQDFLNNFT		LLEICNLTPD		TLSGDYKSYW		HTTFYEGSWR
RGSSAGGCRN		HPGTFWTNPQ		FKISLPEGDD		PEDDAEGNVV		VCTCLVALMQ
KNWRHARQQG		AQLQTIGFVL		YAVPKEFQNI		QDVHLKKEFF		TKYQDHGFSE
IFTNSREVSS		QLRLPPGEYI		IIPSTFEPHR		DADFLLRVFT		EKHSESWELD
EVNYAEQLQE		EKVSEDDMDQ		DFLHLFKIVA		GEGKEIGVYE		LQRLLNRMAI
KFKSFKTKGF		GLDACRCMIN		LMDKDGSGKL		GLLEFKILWK		KLKKWMDIFR
ECDQDHSGTL		NSYEMRLVIE		KAGIKLNNKV		MQVLVARYAD		DDLIIDFDSF
ISCFLRLKTM		FTFFLTMDPK		NTGHICLSLE		QWLQMTMWG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазматичних везикулах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Dear T.N., Moller A., Boehm T. (1999). CAPN11: a calpain with high mRNA levels in testis and located on chromosome 6. Genomics. 59: 243—247. PMID 10409436 DOI:10.1006/geno.1999.5859

Див. також

• Хромосома 6