CAPN5

CAPN5
Ідентифікатори
Символи	CAPN5, ADNIV, HTRA3, VRNI, nCL-3, calpain 5
Зовнішні ІД	OMIM: 602537 MGI: 1100859 HomoloGene: 31212 GeneCards: CAPN5
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity; • cysteine-type peptidase activity; • hydrolase activity; • calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity;
Клітинна компонента	• cell surface; • екзосома; • внутрішньоклітинний; • focal adhesion; • цитоплазма;
Біологічний процес	• GO:0072468 сигнальна трансдукція; • протеоліз;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	726
	12337
	ENSG00000149260
	ENSMUSG00000035547
	O15484
	O08688
	NM_004055
	NM_001301250; NM_007602
	NP_004046
	NP_001288179; NP_031628
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CAPN5 (англ. Calpain 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 640 амінокислот, а молекулярна маса — 73 169^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MFSCVKPYED	QNYSALRRDC	RRRKVLFEDP	LFPATDDSLY	YKGTPGPAVR
WKRPKGICED	PRLFVDGISS	HDLHQGQVGN	CWFVAACSSL	ASRESLWQKV
IPDWKEQEWD	PEKPNAYAGI	FHFHFWRFGE	WVDVVIDDRL	PTVNNQLIYC
HSNSRNEFWC	ALVEKAYAKL	AGCYQALDGG	NTADALVDFT	GGVSEPIDLT
EGDFANDETK	RNQLFERMLK	VHSRGGLISA	SIKAVTAADM	EARLACGLVK
GHAYAVTDVR	KVRLGHGLLA	FFKSEKLDMI	RLRNPWGERE	WNGPWSDTSE
EWQKVSKSER	EKMGVTVQDD	GEFWMTFEDV	CRYFTDIIKC	RVINTSHLSI
HKTWEEARLH	GAWTLHEDPR	QNRGGGCINH	KDTFFQNPQY	IFEVKKPEDE
VLICIQQRPK	RSTRREGKGE	NLAIGFDIYK	VEENRQYRMH	SLQHKAASSI
YINSRSVFLR	TDQPEGRYVI	IPTTFEPGHT	GEFLLRVFTD	VPSNCRELRL
DEPPHTCWSS	LCGYPQLVTQ	VHVLGAAGLK	DSPTGANSYV	IIKCEGDKVR
SAVQKGTSTP	EYNVKGIFYR	KKLSQPITVQ	VWNHRVLKDE	FLGQVHLKAD
PDNLQALHTL	HLRDRNSRQP	SNLPGTVAVH	ILSSTSLMAV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз.

Література[ред. | ред. код]

Mugita N., Kimura Y., Ogawa M., Saya H., Nakao M. (1997). Identification of a novel, tissue-specific calpain htra-3; a human homologue of the Caenorhabditis elegans sex determination gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 239: 845—850. PMID 9367857 DOI:10.1006/bbrc.1997.7571
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Dear T.N., Matena K., Vingron M., Boehm T. (1997). A new subfamily of vertebrate calpains lacking a calmodulin-like domain: implications for calpain regulation and evolution. Genomics. 45: 175—184. PMID 9339374 DOI:10.1006/geno.1997.4870

Примітки[ред. | ред. код]

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1482 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.
↑ UniProt, O15484 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також[ред. | ред. код]

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1482 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O15484 (англ.) . Архів оригіналу за 6 грудня 2016. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

CAPN5

Література[ред. | ред. код]

Примітки[ред. | ред. код]

Див. також[ред. | ред. код]

Навігаційне меню

Пошук