CTSW

CTSW
Ідентифікатори
Символи	CTSW, LYPN, cathepsin W
Зовнішні ІД	OMIM: 602364 MGI: 1338045 HomoloGene: 37471 GeneCards: CTSW
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • лізосома • мембрана • platelet dense granule lumen • extracellular region • міжклітинний простір • ендоплазматичний ретикулум Біологічний процес • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • протеоліз • platelet degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1521	13041
Ensembl	ENSG00000172543	ENSMUSG00000024910
UniProt	P56202	P56203
RefSeq (мРНК)	NM_001335	NM_009985
RefSeq (білок)	NP_001326	NP_034115
Локус (UCSC)	Хр. 11: 65.88 – 65.88 Mb	Хр. 19: 5.52 – 5.52 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CTSW (англ. Cathepsin W) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 376 амінокислот, а молекулярна маса — 42 120.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALTAHPSCL		LALLVAGLAQ		GIRGPLRAQD		LGPQPLELKE		AFKLFQIQFN
RSYLSPEEHA		HRLDIFAHNL		AQAQRLQEED		LGTAEFGVTP		FSDLTEEEFG
QLYGYRRAAG		GVPSMGREIR		SEEPEESVPF		SCDWRKVASA		ISPIKDQKNC
NCCWAMAAAG		NIETLWRISF		WDFVDVSVQE		LLDCGRCGDG		CHGGFVWDAF
ITVLNNSGLA		SEKDYPFQGK		VRAHRCHPKK		YQKVAWIQDF		IMLQNNEHRI
AQYLATYGPI		TVTINMKPLQ		LYRKGVIKAT		PTTCDPQLVD		HSVLLVGFGS
VKSEEGIWAE		TVSSQSQPQP		PHPTPYWILK		NSWGAQWGEK		GYFRLHRGSN
TCGITKFPLT		ARVQKPDMKP		RVSCPP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз.

Література

• Linnevers C., Smeekens S.P., Broemme D. (1997). Human cathepsin W, a putative cysteine protease predominantly expressed in CD8+ T-lymphocytes. FEBS Lett. 405: 253—259. PMID 9108299 DOI:10.1016/S0014-5793(97)00118-X
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 11