G3BP1

G3BP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3Q90, 4FCJ, 4FCM, 4IIA
Ідентифікатори
Символи	G3BP1, G3BP, HDH-VIII, G3BP stress granule assembly factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608431 MGI: 1351465 HomoloGene: 38096 GeneCards: G3BP1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • GO:0008026 helicase activity • GO:0004003 DNA helicase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • nuclease activity • endonuclease activity • ATP binding • hydrolase activity • mRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • мембрана • focal adhesion • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • cytoplasmic stress granule • клітинне ядро • цитоплазма • гіалоплазма • перикаріон • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis • Ras protein signal transduction • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • DNA duplex unwinding • GO:0015915 транспорт • stress granule assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10146	27041
Ensembl	ENSG00000145907	ENSMUSG00000018583
UniProt	Q13283	P97855
RefSeq (мРНК)	NM_005754 NM_198395	NM_013716
RefSeq (білок)	NP_005745 NP_938405	NP_038744
Локус (UCSC)	Хр. 5: 151.77 – 151.81 Mb	Хр. 11: 55.36 – 55.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

G3BP1 (англ. G3BP stress granule assembly factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 466 амінокислот, а молекулярна маса — 52 164.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVMEKPSPLL		VGREFVRQYY		TLLNQAPDML		HRFYGKNSSY		VHGGLDSNGK
PADAVYGQKE		IHRKVMSQNF		TNCHTKIRHV		DAHATLNDGV		VVQVMGLLSN
NNQALRRFMQ		TFVLAPEGSV		ANKFYVHNDI		FRYQDEVFGG		FVTEPQEESE
EEVEEPEERQ		QTPEVVPDDS		GTFYDQAVVS		NDMEEHLEEP		VAEPEPDPEP
EPEQEPVSEI		QEEKPEPVLE		ETAPEDAQKS		SSPAPADIAQ		TVQEDLRTFS
WASVTSKNLP		PSGAVPVTGI		PPHVVKVPAS		QPRPESKPES		QIPPQRPQRD
QRVREQRINI		PPQRGPRPIR		EAGEQGDIEP		RRMVRHPDSH		QLFIGNLPHE
VDKSELKDFF		QSYGNVVELR		INSGGKLPNF		GFVVFDDSEP		VQKVLSNRPI
MFRGEVRLNV		EEKKTRAARE		GDRRDNRLRG		PGGPRGGLGG		GMRGPPRGGM
VQKPGFGVGR		GLAPRQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, нуклеаз, ендонуклеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК, РНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Costa M., Ochem A., Staub A., Falaschi A. (1999). Human DNA helicase VIII: a DNA and RNA helicase corresponding to the G3BP protein, an element of the ras transduction pathway. Nucleic Acids Res. 27: 817—821. PMID 9889278 DOI:10.1093/nar/27.3.817
• Soncini C., Berdo I., Draetta G. (2001). Ras-GAP SH3 domain binding protein (G3BP) is a modulator of USP10, a novel human ubiquitin specific protease. Oncogene. 20: 3869—3879. PMID 11439350 DOI:10.1038/sj.onc.1204553
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Giorgianni F., Zhao Y., Desiderio D.M., Beranova-Giorgianni S. (2007). Toward a global characterization of the phosphoproteome in prostate cancer cells: identification of phosphoproteins in the LNCaP cell line. Electrophoresis. 28: 2027—2034. PMID 17487921 DOI:10.1002/elps.200600782
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 5