HNRNPM

HNRNPM
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DGV, 2DH9, 2DO0, 2OT8
Ідентифікатори
Символи	HNRNPM, CEAR, HNRNPM4, HNRPM, HNRPM4, HTGR1, NAGR1, hnRNP M, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M
Зовнішні ІД	OMIM: 160994 MGI: 1926465 HomoloGene: 4354 GeneCards: HNRNPM
Онтологія гена Молекулярна функція • protein domain specific binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • RNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • paraspeckles • catalytic step 2 spliceosome • мембрана • nuclear matrix • GO:0005578 Позаклітинна матриця • integral component of plasma membrane • нуклеоплазма • ядерце • spliceosomal complex • екзосома • клітинне ядро • цитоплазма • collagen-containing extracellular matrix • post-mRNA release spliceosomal complex • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • Альтернативний сплайсинг • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • Сплайсинг РНК • RNA metabolic process • regulation of mRNA stability involved in response to oxidative stress Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4670	76936
Ensembl	ENSG00000099783	ENSMUSG00000059208
UniProt	P52272	Q9D0E1
RefSeq (мРНК)	NM_001297418 NM_005968 NM_031203	NM_001109913 NM_029804
RefSeq (білок)	NP_001284347 NP_005959 NP_112480	NP_001103383 NP_084080
Локус (UCSC)	Хр. 19: 8.44 – 8.49 Mb	Хр. 17: 33.87 – 33.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HNRNPM (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 730 амінокислот, а молекулярна маса — 77 516.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAGVEAAAE		VAATEIKMEE		ESGAPGVPSG		NGAPGPKGEG		ERPAQNEKRK
EKNIKRGGNR		FEPYANPTKR		YRAFITNIPF		DVKWQSLKDL		VKEKVGEVTY
VELLMDAEGK		SRGCAVVEFK		MEESMKKAAE		VLNKHSLSGR		PLKVKEDPDG
EHARRAMQKV		MATTGGMGMG		PGGPGMITIP		PSILNNPNIP		NEIIHALQAG
RLGSTVFVAN		LDYKVGWKKL		KEVFSMAGVV		VRADILEDKD		GKSRGIGTVT
FEQSIEAVQA		ISMFNGQLLF		DRPMHVKMDE		RALPKGDFFP		PERPQQLPHG
LGGIGMGLGP		GGQPIDANHL		NKGIGMGNIG		PAGMGMEGIG		FGINKMGGME
GPFGGGMENM		GRFGSGMNMG		RINEILSNAL		KRGEIIAKQG		GGGGGGSVPG
IERMGPGIDR		LGGAGMERMG		AGLGHGMDRV		GSEIERMGLV		MDRMGSVERM
GSGIERMGPL		GLDHMASSIE		RMGQTMERIG		SGVERMGAGM		GFGLERMAAP
IDRVGQTIER		MGSGVERMGP		AIERMGLSME		RMVPAGMGAG		LERMGPVMDR
MATGLERMGA		NNLERMGLER		MGANSLERMG		LERMGANSLE		RMGPAMGPAL
GAGIERMGLA		MGGGGGASFD		RAIEMERGNF		GGSFAGSFGG		AGGHAPGVAR
KACQIFVRNL		PFDFTWKMLK		DKFNECGHVL		YADIKMENGK		SKGCGVVKFE
SPEVAERACR		MMNGMKLSGR		EIDVRIDRNA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Datar K.V., Dreyfuss G., Swanson M.S. (1993). The human hnRNP M proteins: identification of a methionine/arginine-rich repeat motif in ribonucleoproteins. Nucleic Acids Res. 21: 439—446. PMID 8441656 DOI:10.1093/nar/21.3.439
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Gocke C.B., Yu H., Kang J. (2005). Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates. J. Biol. Chem. 280: 5004—5012. PMID 15561718 DOI:10.1074/jbc.M411718200
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 19