HNRNPR

HNRNPR
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DK2
Ідентифікатори
Символи	HNRNPR, HNRPR, hnRNP-R, heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R
Зовнішні ІД	OMIM: 607201 MGI: 1891692 HomoloGene: 4251 GeneCards: HNRNPR
Онтологія гена Молекулярна функція • mRNA 3'-UTR binding • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • mRNA binding Клітинна компонента • ядерце • цитоплазма • axon terminus • growth cone • клітинне ядро • внутрішньоклітинна мембранна органела • дендрит (нейробіологія) • ендоплазматичний ретикулум • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • нуклеоплазма • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • циркадний ритм • positive regulation of mRNA catabolic process • mRNA destabilization • GO:0048553 negative regulation of catalytic activity • mRNA processing • mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК • RNA metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10236	74326
Ensembl	ENSG00000282958 ENSG00000125944	ENSMUSG00000066037
UniProt	O43390	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001102397 NM_001102398 NM_001102399 NM_001297620 NM_001297621 NM_001297622 NM_005826	NM_001277121 NM_001277122 NM_001277123 NM_028871 NM_001355182
RefSeq (білок)	NP_001095867 NP_001095868 NP_001095869 NP_001284549 NP_001284550 NP_001284551 NP_005817	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 1: 23.3 – 23.34 Mb	Хр. 4: 136.04 – 136.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HNRNPR (англ. Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 633 амінокислот, а молекулярна маса — 70 943.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MANQVNGNAV		QLKEEEEPMD		TSSVTHTEHY		KTLIEAGLPQ		KVAERLDEIF
QTGLVAYVDL		DERAIDALRE		FNEEGALSVL		QQFKESDLSH		VQNKSAFLCG
VMKTYRQREK		QGSKVQESTK		GPDEAKIKAL		LERTGYTLDV		TTGQRKYGGP
PPDSVYSGVQ		PGIGTEVFVG		KIPRDLYEDE		LVPLFEKAGP		IWDLRLMMDP
LSGQNRGYAF		ITFCGKEAAQ		EAVKLCDSYE		IRPGKHLGVC		ISVANNRLFV
GSIPKNKTKE		NILEEFSKVT		EGLVDVILYH		QPDDKKKNRG		FCFLEYEDHK
SAAQARRRLM		SGKVKVWGNV		VTVEWADPVE		EPDPEVMAKV		KVLFVRNLAT
TVTEEILEKS		FSEFGKLERV		KKLKDYAFVH		FEDRGAAVKA		MDEMNGKEIE
GEEIEIVLAK		PPDKKRKERQ		AARQASRSTA		YEDYYYHPPP		RMPPPIRGRG
RGGGRGGYGY		PPDYYGYEDY		YDDYYGYDYH		DYRGGYEDPY		YGYDDGYAVR
GRGGGRGGRG		APPPPRGRGA		PPPRGRAGYS		QRGAPLGPPR		GSRGGRGGPA
QQQRGRGSRG		SRGNRGGNVG		GKRKADGYNQ		PDSKRRQTNN		QQNWGSQPIA
QQPLQQGGDY		SGNYGYNNDN		QEFYQDTYGQ		QWK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Література

• Huang J., Chen X.H., Wu K., Xu P. (2005). Cloning and expression of a novel isoform of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein-R. NeuroReport. 16: 727—730. PMID 15858414 DOI:10.1097/00001756-200505120-00014
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033

Див. також

• Хромосома 1