HP1BP3

HP1BP3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RQP
Ідентифікатори
Символи	HP1BP3, HP1-BP74, HP1BP74, heterochromatin protein 1 binding protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 616072 MGI: 109369 HomoloGene: 7774 GeneCards: HP1BP3
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleosome binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chromatin binding Клітинна компонента • Нуклеосома • клітинне ядро • хромосома • nuclear speck Біологічний процес • regulation of nucleus size • nucleosome assembly • heterochromatin organization • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • regulation of cell population proliferation • cellular response to hypoxia Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	50809	15441
Ensembl	ENSG00000127483	ENSMUSG00000028759
UniProt	Q5SSJ5	Q3TEA8
RefSeq (мРНК)	NM_016287 NM_001372052	NM_001122896 NM_001122897 NM_001285478 NM_001285479 NM_001285480 NM_001285481 NM_010470 NM_001356431 NM_001356432
RefSeq (білок)	NP_057371 NP_001358981 NP_001363716 NP_001363717 NP_001363718 NP_001363719 NP_001363720 NP_001363721 NP_001363722 NP_001363723 NP_001363724 NP_001363725 NP_001363726	NP_001116368 NP_001116369 NP_001272407 NP_001272408 NP_001272409 NP_001272410 NP_034600 NP_001343360 NP_001343361
Локус (UCSC)	Хр. 1: 20.74 – 20.79 Mb	Хр. 4: 137.94 – 137.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HP1BP3 (англ. Heterochromatin protein 1 binding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 553 амінокислот, а молекулярна маса — 61 207.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATDTSQGEL		VHPKALPLIV		GAQLIHADKL		GEKVEDSTMP		IRRTVNSTRE
TPPKSKLAEG		EEEKPEPDIS		SEESVSTVEE		QENETPPATS		SEAEQPKGEP
ENEEKEENKS		SEETKKDEKD		QSKEKEKKVK		KTIPSWATLS		ASQLARAQKQ
TPMASSPRPK		MDAILTEAIK		ACFQKSGASV		VAIRKYIIHK		YPSLELERRG
YLLKQALKRE		LNRGVIKQVK		GKGASGSFVV		VQKSRKTPQK		SRNRKNRSSA
VDPEPQVKLE		DVLPLAFTRL		CEPKEASYSL		IRKYVSQYYP		KLRVDIRPQL
LKNALQRAVE		RGQLEQITGK		GASGTFQLKK		SGEKPLLGGS		LMEYAILSAI
AAMNEPKTCS		TTALKKYVLE		NHPGTNSNYQ		MHLLKKTLQK		CEKNGWMEQI
SGKGFSGTFQ		LCFPYYPSPG		VLFPKKEPDD		SRDEDEDEDE		SSEEDSEDEE
PPPKRRLQKK		TPAKSPGKAA		SVKQRGSKPA		PKVSAAQRGK		ARPLPKKAPP
KAKTPAKKTR		PSSTVIKKPS		GGSSKKPATS		ARKEVKLPGK		GKSTMKKSFR
VKK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
• Dutta B., Ren Y., Lim S.K., Tam J.P., Sze S.K. (2014). Quantitative profiling of chromatome dynamics reveals a novel role for HP1BP3 in hypoxia-induced oncogenesis. Mol. Cell. Proteomics. 13: 3236—3249. PMID 25100860 DOI:10.1074/mcp.M114.038232

Див. також

• Хромосома 1