ISX

ISX
Ідентифікатори
Символи	ISX, Pix-1, RAXLX, intestine specific homeobox
Зовнішні ІД	OMIM: 612019 MGI: 1918847 HomoloGene: 28312 GeneCards: ISX
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	91464	71597
Ensembl	ENSG00000175329	ENSMUSG00000031621
UniProt	Q2M1V0	A1A546
RefSeq (мРНК)	NM_001303508 NM_001008494	NM_001294278 NM_027837
RefSeq (білок)	NP_001290437	NP_001281207 NP_082113
Локус (UCSC)	Хр. 22: 35.07 – 35.09 Mb	Хр. 8: 75.6 – 75.62 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ISX (англ. Intestine specific homeobox) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 245 амінокислот, а молекулярна маса — 27 011.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MCAEVGPALC		RGMERNSLGC		CEAPKKLSLS		FSIEAILKRP		ARRSDMDRPE
GPGEEGPGEA		AASGSGLEKP		PKDQPQEGRK		SKRRVRTTFT		TEQLHELEKI
FHFTHYPDVH		IRSQLAARIN		LPEARVQIWF		QNQRAKWRKQ		EKIGNLGAPQ
QLSEASVALP		TNLDVAGPTW		TSTALRRLAP		PTSCCPSAQD		QLASAWFPAW
ITLLPAHPWE		TQPVPGLPIH		QTCIPVLCIL		PPPHPKWGSI		CATST

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 22