LIMK1

LIMK1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3S95, 5L6W, 5HVK, 5HVJ
Ідентифікатори
Символи	LIMK1, LIMK, LIMK-1, LIM domain kinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 601329 MGI: 104572 HomoloGene: 1738 GeneCards: LIMK1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • heat shock protein binding • зв'язування з іоном металу • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • ATP binding • protein kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • signal transducer activity Клітинна компонента • мембрана • focal adhesion • цитоплазма • клітинне ядро • комплекс Ґольджі • гіалоплазма • nuclear speck • neuron projection • lamellipodium • cell projection Біологічний процес • Fc-gamma receptor signaling pathway involved in phagocytosis • фосфорилювання • нейробіологія розвитку • negative regulation of ubiquitin-protein transferase activity • Rho protein signal transduction • positive regulation of actin filament bundle assembly • actin cytoskeleton organization • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of axon extension • protein phosphorylation • positive regulation of stress fiber assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3984	16885
Ensembl	ENSG00000106683	ENSMUSG00000029674
UniProt	P53667	P53668
RefSeq (мРНК)	NM_016735 NM_001204426 NM_002314	NM_010717 NM_001305875
RefSeq (білок)	NP_001191355 NP_002305	NP_001292804 NP_034847
Локус (UCSC)	Хр. 7: 74.08 – 74.12 Mb	Хр. 5: 134.68 – 134.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LIMK1 (англ. LIM domain kinase 1) – білок, який кодується однойменним геномом, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 647 амінокислот, а молекулярна маса — 72 585.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRLTLLCCTW		REERMGEEGS		ELPVCASCGQ		RIYDGQYLQA		LNADWHADCF
RCCDCSASLS		HQYYEKDGQL		FCKKDYWARY		GESCHGCSEQ		ITKGLVMVAG
ELKYHPECFI		CLTCGTFIGD		GDTYTLVEHS		KLYCGHCYYQ		TVVTPVIEQI
LPDSPGSHLP		HTVTLVSIPA		SSHGKRGLSV		SIDPPHGPPG		CGTEHSHTVR
VQGVDPGCMS		PDVKNSIHVG		DRILEINGTP		IRNVPLDEID		LLIQETSRLL
QLTLEHDPHD		TLGHGLGPET		SPLSSPAYTP		SGEAGSSARQ		KPVLRSCSID
RSPGAGSLGS		PASQRKDLGR		SESLRVVCRP		HRIFRPSDLI		HGEVLGKGCF
GQAIKVTHRE		TGEVMVMKEL		IRFDEETQRT		FLKEVKVMRC		LEHPNVLKFI
GVLYKDKRLN		FITEYIKGGT		LRGIIKSMDS		QYPWSQRVSF		AKDIASGMAY
LHSMNIIHRD		LNSHNCLVRE		NKNVVVADFG		LARLMVDEKT		QPEGLRSLKK
PDRKKRYTVV		GNPYWMAPEM		INGRSYDEKV		DVFSFGIVLC		EIIGRVNADP
DYLPRTMDFG		LNVRGFLDRY		CPPNCPPSFF		PITVRCCDLD		PEKRPSFVKL
EHWLETLRMH		LAGHLPLGPQ		LEQLDRGFWE		TYRRGESGLP		AHPEVPD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Edwards D.C., Gill G.N. (1999). Structural features of LIM kinase that control effects on the actin cytoskeleton. J. Biol. Chem. 274: 11352—11361. PMID 10196227 DOI:10.1074/jbc.274.16.11352
• Edwards D.C., Sanders L.C., Bokoch G.M., Gill G.N. (1999). Activation of LIM-kinase by Pak1 couples Rac/Cdc42 GTPase signalling to actin cytoskeletal dynamics. Nat. Cell Biol. 1: 253—259. PMID 10559936 DOI:10.1038/12963
• Sumi T., Matsumoto K., Shibuya A., Nakamura T. (2001). Activation of LIM kinases by myotonic dystrophy kinase-related Cdc42-binding kinase alpha. J. Biol. Chem. 276: 23092—23096. PMID 11340065 DOI:10.1074/jbc.C100196200
• Dan C., Kelly A., Bernard O., Minden A. (2001). Cytoskeletal changes regulated by the PAK4 serine/threonine kinase are mediated by LIM kinase 1 and cofilin. J. Biol. Chem. 276: 32115—32121. PMID 11413130 DOI:10.1074/jbc.M100871200
• Niwa R., Nagata-Ohashi K., Takeichi M., Mizuno K., Uemura T. (2002). Control of actin reorganization by Slingshot, a family of phosphatases that dephosphorylate ADF/cofilin. Cell. 108: 233—246. PMID 11832213 DOI:10.1016/S0092-8674(01)00638-9
• Hillman R.T., Green R.E., Brenner S.E. (2004). An unappreciated role for RNA surveillance. Genome Biol. 5: R8.1—R8.16. PMID 14759258 DOI:10.1186/gb-2004-5-2-r8

Див. також

• Хромосома 7