LRRC8B

LRRC8B
Ідентифікатори
Символи	LRRC8B, TA-LRRP, TALRRP, leucine-rich repeat containing 8 family member B, leucine rich repeat containing 8 family member B, leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit B
Зовнішні ІД	OMIM: 612888 MGI: 2141353 HomoloGene: 9103 GeneCards: LRRC8B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • volume-sensitive anion channel activity Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • ендоплазматичний ретикулум • endoplasmic reticulum membrane • клітинна мембрана • іонні канали • integral component of plasma membrane Біологічний процес • ion transport • GO:0072468 сигнальна трансдукція • трансмембранний транспорт • inorganic anion transport • cell volume homeostasis • anion transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23507	433926
Ensembl	ENSG00000197147	ENSMUSG00000070639
UniProt	Q6P9F7	Q5DU41
RefSeq (мРНК)	NM_001134476 NM_015350 NM_001369817 NM_001369819	NM_001033550
RefSeq (білок)	NP_001127948 NP_056165 NP_001356746 NP_001356748	NP_001028722
Локус (UCSC)	Хр. 1: 89.52 – 89.6 Mb	Хр. 5: 105.56 – 105.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LRRC8B (англ. Leucine rich repeat containing 8 family member B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 803 амінокислот, а молекулярна маса — 92 390.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MITLTELKCL		ADAQSSYHIL		KPWWDVFWYY		ITLIMLLVAV		LAGALQLTQS
RVLCCLPCKV		EFDNHCAVPW		DILKASMNTS		SNPGTPLPLP		LRIQNDLHRQ
QYSYIDAVCY		EKQLHWFAKF		FPYLVLLHTL		IFAACSNFWL		HYPSTSSRLE
HFVAILHKCF		DSPWTTRALS		ETVAEQSVRP		LKLSKSKILL		SSSGCSADID
SGKQSLPYPQ		PGLESAGIES		PTSSVLDKKE		GEQAKAIFEK		VKRFRMHVEQ
KDIIYRVYLK		QIIVKVILFV		LIITYVPYFL		THITLEIDCS		VDVQAFTGYK
RYQCVYSLAE		IFKVLASFYV		ILVILYGLTS		SYSLWWMLRS		SLKQYSFEAL
REKSNYSDIP		DVKNDFAFIL		HLADQYDPLY		SKRFSIFLSE		VSENKLKQIN
LNNEWTVEKL		KSKLVKNAQD		KIELHLFMLN		GLPDNVFELT		EMEVLSLELI
PEVKLPSAVS		QLVNLKELRV		YHSSLVVDHP		ALAFLEENLK		ILRLKFTEMG
KIPRWVFHLK		NLKELYLSGC		VLPEQLSTMQ		LEGFQDLKNL		RTLYLKSSLS
RIPQVVTDLL		PSLQKLSLDN		EGSKLVVLNN		LKKMVNLKSL		ELISCDLERI
PHSIFSLNNL		HELDLRENNL		KTVEEIISFQ		HLQNLSCLKL		WHNNIAYIPA
QIGALSNLEQ		LSLDHNNIEN		LPLQLFLCTK		LHYLDLSYNH		LTFIPEEIQY
LSNLQYFAVT		NNNIEMLPDG		LFQCKKLQCL		LLGKNSLMNL		SPHVGELSNL
THLELIGNYL		ETLPPELEGC		QSLKRNCLIV		EENLLNTLPL		PVTERLQTCL
DKC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до іонних каналів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транспорт іонів, транспорт, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Abascal F., Zardoya R. (2012). LRRC8 proteins share a common ancestor with pannexins, and may form hexameric channels involved in cell-cell communication. Bioessays. 34: 551—560. PMID 22532330 DOI:10.1002/bies.201100173

Див. також

• Хромосома 1