NCAN

NCAN
Ідентифікатори
Символи	NCAN, CSPG3, neurocan
Зовнішні ІД	OMIM: 600826 MGI: 104694 HomoloGene: 3229 GeneCards: NCAN
Пов'язані генетичні захворювання
біполярний афективний розлад
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • hyaluronic acid binding • carbohydrate binding • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • Golgi lumen • extracellular region • lysosomal lumen • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • chondroitin sulfate catabolic process • skeletal system development • central nervous system development • chondroitin sulfate biosynthetic process • extracellular matrix organization • dermatan sulfate biosynthetic process • адгезія клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1463	13004
Ensembl	ENSG00000130287	ENSMUSG00000002341
UniProt	O14594	P55066
RefSeq (мРНК)	NM_004386	NM_007789
RefSeq (білок)	NP_004377	NP_031815
Локус (UCSC)	Хр. 19: 19.21 – 19.25 Mb	Хр. 8: 70.55 – 70.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NCAN (англ. Neurocan) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 321 амінокислот, а молекулярна маса — 143 093.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGAPFVWALG		LLMLQMLLFV		AGEQGTQDIT		DASERGLHMQ		KLGSGSVQAA
LAELVALPCL		FTLQPRPSAA		RDAPRIKWTK		VRTASGQRQD		LPILVAKDNV
VRVAKSWQGR		VSLPSYPRRR		ANATLLLGPL		RASDSGLYRC		QVVRGIEDEQ
DLVPLEVTGV		VFHYRSARDR		YALTFAEAQE		ACRLSSAIIA		APRHLQAAFE
DGFDNCDAGW		LSDRTVRYPI		TQSRPGCYGD		RSSLPGVRSY		GRRNPQELYD
VYCFARELGG		EVFYVGPARR		LTLAGARAQC		RRQGAALASV		GQLHLAWHEG
LDQCDPGWLA		DGSVRYPIQT		PRRRCGGPAP		GVRTVYRFAN		RTGFPSPAER
FDAYCFRAHH		PTSQHGDLET		PSSGDEGEIL		SAEGPPVREL		EPTLEEEEVV
TPDFQEPLVS		SGEEETLILE		EKQESQQTLS		PTPGDPMLAS		WPTGEVWLST
VAPSPSDMGA		GTAASSHTEV		APTDPMPRRR		GRFKGLNGRY		FQQQEPEPGL
QGGMEASAQP		PTSEAAVNQM		EPPLAMAVTE		MLGSGQSRSP		WADLTNEVDM
PGAGSAGGKS		SPEPWLWPPT		MVPPSISGHS		RAPVLELEKA		EGPSARPATP
DLFWSPLEAT		VSAPSPAPWE		AFPVATSPDL		PMMAMLRGPK		EWMLPHPTPI
STEANRVEAH		GEATATAPPS		PAAETKVYSL		PLSLTPTGQG		GEAMPTTPES
PRADFRETGE		TSPAQVNKAE		HSSSSPWPSV		NRNVAVGFVP		TETATEPTGL
RGIPGSESGV		FDTAESPTSG		LQATVDEVQD		PWPSVYSKGL		DASSPSAPLG
SPGVFLVPKV		TPNLEPWVAT		DEGPTVNPMD		STVTPAPSDA		SGIWEPGSQV
FEEAESTTLS		PQVALDTSIV		TPLTTLEQGD		KVGVPAMSTL		GSSSSQPHPE
PEDQVETQGT		SGASVPPHQS		SPLGKPAVPP		GTPTAASVGE		SASVSSGEPT
VPWDPSSTLL		PVTLGIEDFE		LEVLAGSPGV		ESFWEEVASG		EEPALPGTPM
NAGAEEVHSD		PCENNPCLHG		GTCNANGTMY		GCSCDQGFAG		ENCEIDIDDC
LCSPCENGGT		CIDEVNGFVC		LCLPSYGGSF		CEKDTEGCDR		GWHKFQGHCY
RYFAHRRAWE		DAEKDCRRRS		GHLTSVHSPE		EHSFINSFGH		ENTWIGLNDR
IVERDFQWTD		NTGLQFENWR		ENQPDNFFAG		GEDCVVMVAH		ESGRWNDVPC
NYNLPYVCKK		GTVLCGPPPA		VENASLIGAR		KAKYNVHATV		RYQCNEGFAQ
HHVATIRCRS		NGKWDRPQIV		CTKPRRSHRM		RRHHHHHQHH		HQHHHHKSRK
ERRKHKKHPT		EDWEKDEGNF		C

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію, лектинами. Секретований назовні.

Література

• Prange C.K., Pennacchio L.A., Lieuallen K., Fan W., Lennon G.G. (1998). Characterization of the human neurocan gene, CSPG3. Gene. 221: 199—205. PMID 9795216 DOI:10.1016/S0378-1119(98)00455-7
• Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Див. також

• Хромосома 19