NOVA1

NOVA1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1DT4, 2ANN, 2ANR
Ідентифікатори
Символи	NOVA1, Nova-1, NOVA alternative splicing regulator 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602157 MGI: 104297 HomoloGene: 21296 GeneCards: NOVA1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • mRNA binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • ядерце • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • locomotory behavior • Сплайсинг РНК • regulation of RNA metabolic process • chemical synaptic transmission • negative regulation of cold-induced thermogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4857	664883
Ensembl	ENSG00000139910	ENSMUSG00000021047
UniProt	P51513	Q9JKN6
RefSeq (мРНК)	NM_002515 NM_006489 NM_006491	NM_021361 NM_001364634 NM_001364635 NM_001364636 NM_001364637 NM_001364638 NM_001364639
RefSeq (білок)	NP_002506 NP_006480 NP_006482 NP_001353319 NP_001353320 NP_001353321 NP_001353322 NP_001353323 NP_001353324 NP_001353325 NP_001353326 NP_001353327	NP_067336 NP_001351563 NP_001351564 NP_001351565 NP_001351566 NP_001351567 NP_001351568
Локус (UCSC)	Хр. 14: 26.44 – 26.6 Mb	Хр. 12: 46.69 – 46.82 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NOVA1 (англ. NOVA alternative splicing regulator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 510 амінокислот, а молекулярна маса — 52 056.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMAAAPIQQN		GTHTGVPIDL		DPPDSRKRPL		EAPPEAGSTK		RTNTGEDGQY
FLKVLIPSYA		AGSIIGKGGQ		TIVQLQKETG		ATIKLSKLSK		SKDFYPGTTE
RVCLIQGTVE		ALNAVHGFIA		EKIREMPQNV		AKTEPVSILQ		PQTTVNPDRI
KQTLPSSPTT		TKSSPSDPMT		TSRANQVKII		VPNSTAGLII		GKGGATVKAV
MEQSGAWVQL		SQKPDGINLQ		ERVVTVSGEP		EQNRKAVELI		IQKIQEDPQS
GSCLNISYAN		VTGPVANSNP		TGSPYANTAE		VLPTAAAAAG		LLGHANLAGV
AAFPAVLSGF		TGNDLVAITS		ALNTLASYGY		NLNTLGLGLS		QAAATGALAA
AAASANPAAA		AANLLATYAS		EASASGSTAG		GTAGTFALGS		LAAATAATNG
YFGAASPLAA		SAILGTEKST		DGSKDVVEIA		VPENLVGAIL		GKGGKTLVEY
QELTGARIQI		SKKGEFVPGT		RNRKVTITGT		PAATQAAQYL		ITQRITYEQG
VRAANPQKVG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Buckanovich R.J., Posner J.B., Darnell R.B. (1993). Nova, the paraneoplastic Ri antigen, is homologous to an RNA-binding protein and is specifically expressed in the developing motor system. Neuron. 11: 657—672. PMID 8398153 DOI:10.1016/0896-6273(93)90077-5
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 14