OTUD6B

OTUD6B
Ідентифікатори
Символи	OTUD6B, DUBA-5, DUBA5, CGI-77, OTU domain containing 6B, IDDFSDA, OTU deubiquitinase 6B
Зовнішні ІД	OMIM: 612021 MGI: 1919451 HomoloGene: 6064 GeneCards: OTUD6B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity • thiol-dependent deubiquitinase Клітинна компонента • eukaryotic translation initiation factor 4F complex Біологічний процес • протеоліз • проліферація • protein deubiquitination • negative regulation of translation • proteasome assembly • positive regulation of translation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51633	72201
Ensembl	ENSG00000155100	ENSMUSG00000040550
UniProt	Q8N6M0	Q8K2H2
RefSeq (мРНК)	NM_001286745 NM_016023	NM_152812
RefSeq (білок)	NP_001273674 NP_057107	NP_690025
Локус (UCSC)	Хр. 8: 91.07 – 91.09 Mb	Хр. 4: 14.81 – 14.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OTUD6B (англ. OTU domain containing 6B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 293 амінокислот, а молекулярна маса — 33 813.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAVLTEELD		EEEQLLRRHR		KEKKELQAKI		QGMKNAVPKN		DKKRRKQLTE
DVAKLEKEME		QKHREELEQL		KLTTKENKID		SVAVNISNLV		LENQPPRISK
AQKRREKKAA		LEKEREERIA		EAEIENLTGA		RHMESEKLAQ		ILAARQLEIK
QIPSDGHCMY		KAIEDQLKEK		DCALTVVALR		SQTAEYMQSH		VEDFLPFLTN
PNTGDMYTPE		EFQKYCEDIV		NTAAWGGQLE		LRALSHILQT		PIEIIQADSP
PIIVGEEYSK		KPLILVYMRH		AYGLGEHYNS		VTRLVNIVTE		NCS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 8