PGLYRP2

PGLYRP2
Ідентифікатори
Символи	PGLYRP2, HMFT0141, PGLYRPL, PGRP-L, PGRPL, TAGL-like, tagL, tagL-alpha, tagl-beta, peptidoglycan recognition protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608199 MGI: 1928099 HomoloGene: 49671 GeneCards: PGLYRP2
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • zinc ion binding • hydrolase activity • peptidoglycan immune receptor activity • peptidoglycan binding • N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity Клітинна компонента • внутрішньоклітинний • мембрана • екзосома • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • процес імунної системи • peptide amidation • negative regulation of natural killer cell differentiation involved in immune response • negative regulation of interferon-gamma production • вроджений імунітет • detection of bacterium • regulation of inflammatory response • GO:0051637 defense response to Gram-positive bacterium • peptidoglycan catabolic process • pattern recognition receptor signaling pathway • antimicrobial humoral response Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	114770	57757
Ensembl	ENSG00000161031	ENSMUSG00000079563
UniProt	Q96PD5	Q8VCS0
RefSeq (мРНК)	NM_052890 NM_001363546	NM_001271476 NM_001271477 NM_001271478 NM_001271479 NM_021319
RefSeq (білок)	NP_443122 NP_001350475	NP_001258405 NP_001258406 NP_001258407 NP_001258408 NP_067294
Локус (UCSC)	Хр. 19: 15.47 – 15.5 Mb	Хр. 17: 32.63 – 32.64 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PGLYRP2 (англ. Peptidoglycan recognition protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 576 амінокислот, а молекулярна маса — 62 217.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQGVLWILL		GLLLWSDPGT		ASLPLLMDSV		IQALAELEQK		VPAAKTRHTA
SAWLMSAPNS		GPHNRLYHFL		LGAWSLNATE		LDPCPLSPEL		LGLTKEVARH
DVREGKEYGV		VLAPDGSTVA		VEPLLAGLEA		GLQGRRVINL		PLDSMAAPWE
TGDTFPDVVA		IAPDVRATSS		PGLRDGSPDV		TTADIGANTP		DATKGCPDVQ
ASLPDAKAKS		PPTMVDSLLA		VTLAGNLGLT		FLRGSQTQSH		PDLGTEGCWD
QLSAPRTFTL		LDPKASLLTM		AFLNGALDGV		ILGDYLSRTP		EPRPSLSHLL
SQYYGAGVAR		DPGFRSNFRR		QNGAALTSAS		ILAQQVWGTL		VLLQRLEPVH
LQLQCMSQEQ		LAQVAANATK		EFTEAFLGCP		AIHPRCRWGA		APYRGRPKLL
QLPLGFLYVH		HTYVPAPPCT		DFTRCAANMR		SMQRYHQDTQ		GWGDIGYSFV
VGSDGYVYEG		RGWHWVGAHT		LGHNSRGFGV		AIVGNYTAAL		PTEAALRTVR
DTLPSCAVRA		GLLRPDYALL		GHRQLVRTDC		PGDALFDLLR		TWPHFTATVK
PRPARSVSKR		SRREPPPRTL		PATDLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як імунітет. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Liu C., Xu Z., Gupta D., Dziarski R. (2001). Peptidoglycan recognition proteins: a novel family of four human innate immunity pattern recognition molecules. J. Biol. Chem. 276: 34686—34694. PMID 11461926 DOI:10.1074/jbc.M105566200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• De Pauw P., Neyt C., Vanderwinkel E., Wattiez R., Falmagne P. (1995). Characterization of human serum N-acetylmuramyl-L-alanine amidase purified by affinity chromatography. Protein Expr. Purif. 6: 371—378. PMID 7663175 DOI:10.1006/prep.1995.1049
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 DOI:10.1038/nbt827

Див. також

• Хромосома 19