PIK3R4

PIK3R4
Ідентифікатори
Символи	PIK3R4, VPS15, p150, phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4
Зовнішні ІД	OMIM: 602610 MGI: 1922919 HomoloGene: 24678 GeneCards: PIK3R4
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity Клітинна компонента • гіалоплазма • ендосома • late endosome • phagocytic vesicle membrane • мембрана • phosphatidylinositol 3-kinase complex, class III • Ядерна пора • autophagosome • phosphatidylinositol 3-kinase complex, class III, type I • GO:0035085 Аксонема • nucleus-vacuole junction • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • phosphatidylinositol 3-kinase complex, class III, type II • microtubule cytoskeleton • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • cellular response to glucose starvation • regulation of cytokinesis • фосфорилювання • late endosome to vacuole transport • autophagy of peroxisome • receptor catabolic process • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • protein phosphorylation • phosphatidylinositol biosynthetic process • protein targeting to vacuole • toll-like receptor 9 signaling pathway • macroautophagy • phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	30849	75669
Ensembl	ENSG00000196455	ENSMUSG00000032571
UniProt	Q99570	Q8VD65
RefSeq (мРНК)	NM_014602	NM_001081309 NM_029380
RefSeq (білок)	NP_055417	NP_001074778
Локус (UCSC)	Хр. 3: 130.68 – 130.75 Mb	Хр. 9: 105.52 – 105.56 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PIK3R4 (англ. Phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 358 амінокислот, а молекулярна маса — 153 103.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGNQLAGIAP		SQILSVESYF		SDIHDFEYDK		SLGSTRFFKV		ARAKHREGLV
VVKVFAIQDP		TLPLTSYKQE		LEELKIRLNS		AQNCLPFQKA		SEKASEKAAM
LFRQYVRDNL		YDRISTRPFL		NNIEKRWIAF		QILTAVDQAH		KSGVRHGDIK
TENVMVTSWN		WVLLTDFASF		KPTYLPEDNP		ADFNYFFDTS		RRRTCYIAPE
RFVDGGMFAT		ELEYMRDPST		PLVDLNSNQR		TRGELKRAMD		IFSAGCVIAE
LFTEGVPLFD		LSQLLAYRNG		HFFPEQVLNK		IEDHSIRELV		TQMIHREPDK
RLEAEDYLKQ		QRGNAFPEIF		YTFLQPYMAQ		FAKETFLSAD		ERILVIRKDL
GNIIHNLCGH		DLPEKAEGEP		KENGLVILVS		VITSCLQTLK		YCDSKLAALE
LILHLAPRLS		VEILLDRITP		YLLHFSNDSV		PRVRAEALRT		LTKVLALVKE
VPRNDINIYP		EYILPGIAHL		AQDDATIVRL		AYAENIALLA		ETALRFLELV
QLKNLNMEND		PNNEEIDEVT		HPNGNYDTEL		QALHEMVQQK		VVTLLSDPEN
IVKQTLMENG		ITRLCVFFGR		QKANDVLLSH		MITFLNDKND		WHLRGAFFDS
IVGVAAYVGW		QSSSILKPLL		QQGLSDAEEF		VIVKALYALT		CMCQLGLLQK
PHVYEFASDI		APFLCHPNLW		IRYGAVGFIT		VVARQISTAD		VYCKLMPYLD
PYITQPIIQI		ERKLVLLSVL		KEPVSRSIFD		YALRSKDITS		LFRHLHMRQK
KRNGSLPDCP		PPEDPAIAQL		LKKLLSQGMT		EEEEDKLLAL		KDFMMKSNKA
KANIVDQSHL		HDSSQKGVID		LAALGITGRQ		VDLVKTKQEP		DDKRARKHVK
QDSNVNEEWK		SMFGSLDPPN		MPQALPKGSD		QEVIQTGKPP		RSESSAGICV
PLSTSSQVPE		VTTVQNKKPV		IPVLSSTILP		STYQIRITTC		KTELQQLIQQ
KREQCNAERI		AKQMMENAEW		ESKPPPPGWR		PKGLLVAHLH		EHKSAVNRIR
VSDEHSLFAT		CSNDGTVKIW		NSQKMEGKTT		TTRSILTYSR		IGGRVKTLTF
CQGSHYLAIA		SDNGAVQLLG		IEASKLPKSP		KIHPLQSRIL		DQKEDGCVVD
MHHFNSGAQS		VLAYATVNGS		LVGWDLRSSS		NAWTLKHDLK		SGLITSFAVD
IHQCWLCIGT		SSGTMACWDM		RFQLPISSHC		HPSRARIRRL		SMHPLYQSWV
IAAVQGNNEV		SMWDMETGDR		RFTLWASSAP		PLSELQPSPH		SVHGIYCSPA
DGNPILLTAG		SDMKIRFWDL		AYPERSYVVA		GSTSSPSVSY		YRKIIEGTEV
VQEIQNKQKV		GPSDDTPRRG		PESLPVGHHD		IITDVATFQT		TQGFIVTASR
DGIVKVWK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у мембрані, цитоплазматичних везикулах, ендосомах.

Література

• Panaretou C., Domin J., Cockcroft S., Waterfield M.D. (1997). Characterization of p150, an adaptor protein for the human phosphatidylinositol (PtdIns) 3-kinase. Substrate presentation by phosphatidylinositol transfer protein to the p150.PtdIns 3-kinase complex. J. Biol. Chem. 272: 2477—2485. PMID 8999962 DOI:10.1074/jbc.272.4.2477
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Stein M.P., Feng Y., Cooper K.L., Welford A.M., Wandinger-Ness A. (2003). Human VPS34 and p150 are Rab7 interacting partners. Traffic. 4: 754—771. PMID 14617358 DOI:10.1034/j.1600-0854.2003.00133.x
• Thoresen S.B., Pedersen N.M., Liestol K., Stenmark H. (2010). A phosphatidylinositol 3-kinase class III sub-complex containing VPS15, VPS34, Beclin 1, UVRAG and BIF-1 regulates cytokinesis and degradative endocytic traffic. Exp. Cell Res. 316: 3368—3378. PMID 20643123 DOI:10.1016/j.yexcr.2010.07.008

Див. також

• Хромосома 3