PRX

PRX
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4CMZ
Ідентифікатори
Символи	PRX, CMT4F, periaxin
Зовнішні ІД	OMIM: 605725 MGI: 108176 HomoloGene: 76542 GeneCards: PRX
Пов'язані генетичні захворювання
Dejerine–Sottas disease
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • молекулярна функція Клітинна компонента • цитоплазма • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • мембрана • клітинне ядро • T-tubule Біологічний процес • axon ensheathment • regulation of RNA splicing Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	57716	19153
Ensembl	ENSG00000105227	ENSMUSG00000053198
UniProt	Q9BXM0	O55103
RefSeq (мРНК)	NM_020956 NM_181882	NM_019412 NM_198048
RefSeq (білок)	NP_066007 NP_870998	NP_062285 NP_932165
Локус (UCSC)	Хр. 19: 40.39 – 40.41 Mb	Хр. 7: 27.2 – 27.22 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PRX (англ. Periaxin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 461 амінокислот, а молекулярна маса — 154 905.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEARSRSAEE		LRRAELVEII		VETEAQTGVS		GINVAGGGKE		GIFVRELRED
SPAARSLSLQ		EGDQLLSARV		FFENFKYEDA		LRLLQCAEPY		KVSFCLKRTV
PTGDLALRPG		TVSGYEIKGP		RAKVAKLNIQ		SLSPVKKKKM		VPGALGVPAD
LAPVDVEFSF		PKFSRLRRGL		KAEAVKGPVP		AAPARRRLQL		PRLRVREVAE
EAQAARLAAA		APPPRKAKVE		AEVAAGARFT		APQVELVGPR		LPGAEVGVPQ
VSAPKAAPSA		EAAGGFALHL		PTLGLGAPAP		PAVEAPAVGI		QVPQVELPAL
PSLPTLPTLP		CLETREGAVS		VVVPTLDVAA		PTVGVDLALP		GAEVEARGEA
PEVALKMPRL		SFPRFGARAK		EVAEAKVAKV		SPEARVKGPR		LRMPTFGLSL
LEPRPAAPEV		VESKLKLPTI		KMPSLGIGVS		GPEVKVPKGP		EVKLPKAPEV
KLPKVPEAAL		PEVRLPEVEL		PKVSEMKLPK		VPEMAVPEVR		LPEVELPKVS
EMKLPKVPEM		AVPEVRLPEV		QLLKVSEMKL		PKVPEMAVPE		VRLPEVQLPK
VSEMKLPEVS		EVAVPEVRLP		EVQLPKVPEM		KVPEMKLPKV		PEMKLPEMKL
PEVQLPKVPE		MAVPDVHLPE		VQLPKVPEMK		LPEMKLPEVK		LPKVPEMAVP
DVHLPEVQLP		KVPEMKLPKM		PEMAVPEVRL		PEVQLPKVSE		MKLPKVPEMA
VPDVHLPEVQ		LPKVCEMKVP		DMKLPEIKLP		KVPEMAVPDV		HLPEVQLPKV
SEIRLPEMQV		PKVPDVHLPK		APEVKLPRAP		EVQLKATKAE		QAEGMEFGFK
MPKMTMPKLG		RAESPSRGKP		GEAGAEVSGK		LVTLPCLQPE		VDGEAHVGVP
SLTLPSVELD		LPGALGLQGQ		VPAAKMGKGE		RVEGPEVAAG		VREVGFRVPS
VEIVTPQLPA		VEIEEGRLEM		IETKVKPSSK		FSLPKFGLSG		PKVAKAEAEG
AGRATKLKVS		KFAISLPKAR		VGAEAEAKGA		GEAGLLPALD		LSIPQLSLDA
HLPSGKVEVA		GADLKFKGPR		FALPKFGVRG		RDTEAAELVP		GVAELEGKGW
GWDGRVKMPK		LKMPSFGLAR		GKEAEVQGDR		ASPGEKAEST		AVQLKIPEVE
LVTLGAQEEG		RAEGAVAVSG		MQLSGLKVST		AGQVVTEGHD		AGLRMPPLGI
SLPQVELTGF		GEAGTPGQQA		QSTVPSAEGT		AGYRVQVPQV		TLSLPGAQVA
GGELLVGEGV		FKMPTVTVPQ		LELDVGLSRE		AQAGEAATGE		GGLRLKLPTL
GARARVGGEG		AEEQPPGAER		TFCLSLPDVE		LSPSGGNHAE		YQVAEGEGEA
GHKLKVRLPR		FGLVRAKEGA		EEGEKAKSPK		LRLPRVGFSQ		SEMVTGEGSP
SPEEEEEEEE		EGSGEGASGR		RGRVRVRLPR		VGLAAPSKAS		RGQEGDAAPK
SPVREKSPKF		RFPRVSLSPK		ARSGSGDQEE		GGLRVRLPSV		GFSETGAPGP
ARMEGAQAAA		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клітинних контактах.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 DOI:10.1093/dnares/7.4.271
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shi Y., Zhang L., Yang T. (2014). Nuclear export of L-periaxin, mediated by its nuclear export signal in the PDZ domain. PLoS ONE. 9: E91953—E91953. PMID 24633211 DOI:10.1371/journal.pone.0091953
• Han H., Kursula P. (2014). Periaxin and AHNAK nucleoprotein 2 form intertwined homodimers through domain swapping. J. Biol. Chem. 289: 14121—14131. PMID 24675079 DOI:10.1074/jbc.M114.554816

Див. також

• Хромосома 19