PSMC1

PSMC1
Ідентифікатори
Символи	PSMC1, P26S4, S4, p56, proteasome 26S subunit, ATPase 1, RPT2
Зовнішні ІД	OMIM: 602706 MGI: 106054 HomoloGene: 2095 GeneCards: PSMC1
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • ATPase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • hydrolase activity • TBP-class protein binding • RNA binding • proteasome-activating activity Клітинна компонента • nuclear proteasome complex • proteasome regulatory particle, base subcomplex • proteasome regulatory particle • cytosolic proteasome complex • proteasome accessory complex • мембрана • нуклеоплазма • клітинне ядро • Протеасома • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly • regulation of cellular amino acid metabolic process • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • regulation of mRNA stability • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • protein polyubiquitination • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • MAPK cascade • Fc-epsilon receptor signaling pathway • GO:0044257 protein catabolic process • NIK/NF-kappaB signaling • ubiquitin-dependent ERAD pathway • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • T cell receptor signaling pathway • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of neuron death • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • positive regulation of proteasomal protein catabolic process • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • згортання білків • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • трансмембранний транспорт • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • посттрансляційна модифікація • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • interleukin-1-mediated signaling pathway • regulation of mitotic cell cycle phase transition Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5700	19179
Ensembl	ENSG00000100764	ENSMUSG00000021178
UniProt	P62191	P62192
RefSeq (мРНК)	NM_002802 NM_001330212	NM_008947
RefSeq (білок)	NP_001317141 NP_002793	NP_032973
Локус (UCSC)	Хр. 14: 90.26 – 90.28 Mb	Хр. 12: 100.08 – 100.09 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PSMC1 (англ. Proteasome 26S subunit, ATPase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 440 амінокислот, а молекулярна маса — 49 185.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGQSQSGGHG		PGGGKKDDKD		KKKKYEPPVP		TRVGKKKKKT		KGPDAASKLP
LVTPHTQCRL		KLLKLERIKD		YLLMEEEFIR		NQEQMKPLEE		KQEEERSKVD
DLRGTPMSVG		TLEEIIDDNH		AIVSTSVGSE		HYVSILSFVD		KDLLEPGCSV
LLNHKVHAVI		GVLMDDTDPL		VTVMKVEKAP		QETYADIGGL		DNQIQEIKES
VELPLTHPEY		YEEMGIKPPK		GVILYGPPGT		GKTLLAKAVA		NQTSATFLRV
VGSELIQKYL		GDGPKLVREL		FRVAEEHAPS		IVFIDEIDAI		GTKRYDSNSG
GEREIQRTML		ELLNQLDGFD		SRGDVKVIMA		TNRIETLDPA		LIRPGRIDRK
IEFPLPDEKT		KKRIFQIHTS		RMTLADDVTL		DDLIMAKDDL		SGADIKAICT
EAGLMALRER		RMKVTNEDFK		KSKENVLYKK		QEGTPEGLYL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Katiyar S., Li G., Lennarz W.J. (2004). A complex between peptide:N-glycanase and two proteasome-linked proteins suggests a mechanism for the degradation of misfolded glycoproteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 13774—13779. PMID 15358861 DOI:10.1073/pnas.0405663101
• Denis N.J., Vasilescu J., Lambert J.-P., Smith J.C., Figeys D. (2007). Tryptic digestion of ubiquitin standards reveals an improved strategy for identifying ubiquitinated proteins by mass spectrometry. Proteomics. 7: 868—874. PMID 17370265 DOI:10.1002/pmic.200600410
• Huang X., Luan B., Wu J., Shi Y. (2016). An atomic structure of the human 26S proteasome. Nat. Struct. Mol. Biol. 23: 778—785. PMID 27428775 DOI:10.1038/nsmb.3273
• Dubiel W., Ferrell K., Pratt G., Rechsteiner M.C. (1992). Subunit 4 of the 26 S protease is a member of a novel eukaryotic ATPase family. J. Biol. Chem. 267: 22699—22702. PMID 1429620

Див. також

• Хромосома 14