RABEPK

RABEPK
Ідентифікатори
Символи	RABEPK, RAB9P40, bA65N13.1, p40, Rab9 effector protein with kelch motifs
Зовнішні ІД	OMIM: 605962 MGI: 2139530 HomoloGene: 48772 GeneCards: RABEPK
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10244	227746
Ensembl	ENSG00000136933	ENSMUSG00000070953
UniProt	Q7Z6M1 Q5T1S5	Q8VCH5
RefSeq (мРНК)	NM_001174152 NM_001174153 NM_005833	NM_145522 NM_001374669
RefSeq (білок)	NP_001167623 NP_001167624 NP_005824	NP_663497 NP_001361598
Локус (UCSC)	Хр. 9: 125.2 – 125.23 Mb	Хр. 2: 34.67 – 34.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RABEPK (англ. Rab9 effector protein with kelch motifs) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 40 565.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKQLPVLEPG		DKPRKATWYT		LTVPGDSPCA		RVGHSCSYLP		PVGNAKRGKV
FIVGGANPNR		SFSDVHTMDL		GKHQWDLDTC		KGLLPRYEHA		SFIPSCTPDR
IWVFGGANQS		GNRNCLQVLN		PETRTWTTPE		VTSPPPSPRT		FHTSSAAIGN
QLYVFGGGER		GAQPVQDTKL		HVFDANTLTW		SQPETLGNPP		SPRHGHVMVA
AGTKLFIHGG		LAGDRFYDDL		HCIDISDMKW		QKLNPTGAAP		AGCAAHSAVA
MGKHVYIFGG		MTPAGALDTM		YQYHTEEQHW		TLLKFDTLLP		PGRLDHSMCI
IPWPVTCASE		KEDSNSLTLN		HEAEKEDSAD		KVMSHSGDSH		EESQTATLLC
LVFGGMNTEG		EIYDDCIVTV		VD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• Diaz E., Schimmoller F., Pfeffer S.R. (1997). A novel Rab9 effector required for endosome-to-TGN transport. J. Cell Biol. 138: 283—290. PMID 9230071 DOI:10.1083/jcb.138.2.283
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Aivazian D., Serrano R.L., Pfeffer S. (2006). TIP47 is a key effector for Rab9 localization. J. Cell Biol. 173: 917—926. PMID 16769818 DOI:10.1083/jcb.200510010

Див. також

• Хромосома 9