RAD51D

RAD51D
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KZ3
Ідентифікатори
Символи	RAD51D, BROVCA4, R51H3, RAD51L3, TRAD, RAD51 paralog D
Зовнішні ІД	OMIM: 602954 MGI: 1261809 HomoloGene: 2156 GeneCards: RAD51D
Пов'язані генетичні захворювання
рак яєчника, hereditary breast ovarian cancer
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • nucleotide binding • ATP-dependent activity, acting on DNA • DNA strand exchange activity • single-stranded DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • four-way junction DNA binding • gamma-tubulin binding • double-stranded DNA binding • endodeoxyribonuclease activity • ATP binding Клітинна компонента • цитоплазма • центросома • replication fork • хромосома • центр організації мікротрубочок • теломера • Rad51B-Rad51C-Rad51D-XRCC2 complex • цитоскелет • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • strand invasion • response to ionizing radiation • nucleotide-excision repair • reciprocal meiotic recombination • DNA recombination • interstrand cross-link repair • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization • regulation of cell cycle • cellular response to DNA damage stimulus • mitotic recombination • telomere maintenance • GO:0100026 Репарація ДНК • meiotic DNA recombinase assembly • double-strand break repair via homologous recombination Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5892	19364
Ensembl	ENSG00000185379	ENSMUSG00000018841
UniProt	O75771	O55230
RefSeq (мРНК)	NM_001142571 NM_002878 NM_133627 NM_133628 NM_133629 NM_133630	NM_001277938 NM_001277939 NM_001277941 NM_001277942 NM_011235
RefSeq (білок)	NP_001136043 NP_002869 NP_598332	NP_001264867 NP_001264868 NP_001264870 NP_001264871 NP_035365
Локус (UCSC)	Хр. 17: 35.09 – 35.12 Mb	Хр. 11: 82.77 – 82.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAD51D (англ. RAD51 paralog D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 328 амінокислот, а молекулярна маса — 35 049.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGVLRVGLCP		GLTEEMIQLL		RSHRIKTVVD		LVSADLEEVA		QKCGLSYKAL
VALRRVLLAQ		FSAFPVNGAD		LYEELKTSTA		ILSTGIGSLD		KLLDAGLYTG
EVTEIVGGPG		SGKTQVCLCM		AANVAHGLQQ		NVLYVDSNGG		LTASRLLQLL
QAKTQDEEEQ		AEALRRIQVV		HAFDIFQMLD		VLQELRGTVA		QQVTGSSGTV
KVVVVDSVTA		VVSPLLGGQQ		REGLALMMQL		ARELKTLARD		LGMAVVVTNH
ITRDRDSGRL		KPALGRSWSF		VPSTRILLDT		IEGAGASGGR		RMACLAKSSR
QPTGFQEMVD		IGTWGTSEQS		ATLQGDQT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як пошкодження ДНК, репарація ДНК, рекомбінація ДНК, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, хромосомах.

Література

• Cartwright R., Dunn A.M., Simpson P.J., Tambini C.E., Thacker J. (1998). Isolation of novel human and mouse genes of the recA/RAD51 recombination-repair gene family. Nucleic Acids Res. 26: 1653—1659. PMID 9512535 DOI:10.1093/nar/26.7.1653
• Pittman D.L., Weinberg L.R., Schimenti J.C. (1998). Identification, characterization, and genetic mapping of Rad51d, a new mouse and human RAD51/RecA-related gene. Genomics. 49: 103—111. PMID 9570954 DOI:10.1006/geno.1998.5226
• Kawabata M., Saeki K. (1999). Multiple alternative transcripts of the human homologue of the mouse TRAD/R51H3/RAD51D gene, a member of the recA/RAD51 gene family. Biochem. Biophys. Res. Commun. 257: 156—162. PMID 10092526 DOI:10.1006/bbrc.1999.0413
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Braybrooke J.P., Spink K.G., Thacker J., Hickson I.D. (2000). The RAD51 family member, RAD51L3, is a DNA-stimulated ATPase that forms a complex with XRCC2. J. Biol. Chem. 275: 29100—29106. PMID 10871607 DOI:10.1074/jbc.M002075200
• Liu N., Schild D., Thelen M.P., Thompson L.H. (2002). Involvement of Rad51C in two distinct protein complexes of Rad51 paralogs in human cells. Nucleic Acids Res. 30: 1009—1015. PMID 11842113 DOI:10.1093/nar/30.4.1009

Див. також

• Хромосома 17