RBM11

RBM11
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YWK
Ідентифікатори
Символи	RBM11, RNA binding motif protein 11
Зовнішні ІД	OMIM: 617937 MGI: 2447622 HomoloGene: 16988 GeneCards: RBM11
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • RNA binding • poly(U) RNA binding • single-stranded RNA binding Клітинна компонента • nuclear speck • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • multicellular organism development • cellular response to oxidative stress • mRNA processing • диференціація клітин • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54033	224344
Ensembl	ENSG00000185272	ENSMUSG00000032940
UniProt	P57052	Q80YT9
RefSeq (мРНК)	NM_144770 NM_001320602	NM_198302
RefSeq (білок)	NP_001307531 NP_658983	NP_938044
Локус (UCSC)	Хр. 21: 14.22 – 14.23 Mb	Хр. 16: 75.39 – 75.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RBM11 (англ. RNA binding motif protein 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 281 амінокислот, а молекулярна маса — 32 179.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFPAQEEADR		TVFVGNLEAR		VREEILYELF		LQAGPLTKVT		ICKDREGKPK
SFGFVCFKHP		ESVSYAIALL		NGIRLYGRPI		NVQYRFGSSR		SSEPANQSFE
SCVKINSHNY		RNEEMLVGRS		SFPMQYFPIN		NTSLPQEYFL		FQKMQWHVYN
PVLQLPYYEM		TAPLPNSASV		SSSLNHVPDL		EAGPSSYKWT		HQQPSDSDLY
QMTAPLPNSA		SVSSSLNHVP		DLEAGPSSYK		WTHQQPSDSD		LYQMNKRKRQ
KQTSDSDSST		DNNRGNECSQ		KFRKSKKKKR		Y

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gardiner K., Slavov D., Bechtel L., Davisson M. (2002). Annotation of human chromosome 21 for relevance to Down syndrome: gene structure and expression analysis. Genomics. 79: 833—843. PMID 12036298 DOI:10.1006/geno.2002.6782
• Brun M.-E., Ruault M., Ventura M., Roizes G., De Sario A. (2003). Juxtacentromeric region of human chromosome 21: a boundary between centromeric heterochromatin and euchromatic chromosome arms. Gene. 312: 41—50. PMID 12909339 DOI:10.1016/S0378-1119(03)00530-4
• Pedrotti S., Busa R., Compagnucci C., Sette C. (2012). The RNA recognition motif protein RBM11 is a novel tissue-specific splicing regulator. Nucleic Acids Res. 40: 1021—1032. PMID 21984414 DOI:10.1093/nar/gkr819

Див. також

• Хромосома 21