RCOR1

RCOR1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2IW5, 2UXN, 2UXX, 2V1D, 2X0L, 2XAF, 2XAG, 2XAH, 2XAJ, 2XAQ, 2XAS, 2Y48, 3ZMS, 3ZMT, 3ZMU, 3ZMV, 3ZMZ, 3ZN0, 3ZN1, 4BAY, 4KUM, 4UV8, 4UV9, 4UVA, 4UVB, 4UVC, 4UXN, 5L3D, 5L3B, 5L3C, 4XBF
Ідентифікатори
Символи	RCOR1, COREST, RCOR, REST corepressor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607675 MGI: 106340 HomoloGene: 32246 GeneCards: RCOR1
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transcription factor binding • histone deacetylase activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity Клітинна компонента • DNA repair complex • transcription repressor complex • клітинне ядро • transcription regulator complex • нуклеоплазма Біологічний процес • histone H4 deacetylation • GO:0022415 viral process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • зсідання крові • transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23186	217864
Ensembl	ENSG00000089902	ENSMUSG00000037896
UniProt	Q9UKL0	Q8CFE3
RefSeq (мРНК)	NM_015156	NM_198023
RefSeq (білок)	NP_055971	NP_932140
Локус (UCSC)	Хр. 14: 102.59 – 102.73 Mb	Хр. 12: 111.01 – 111.08 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RCOR1 (англ. REST corepressor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 485 амінокислот, а молекулярна маса — 53 327.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPAMVEKGPE		VSGKRRGRNN		AAASASAAAA		SAAASAACAS		PAATAASGAA
ASSASAAAAS		AAAAPNNGQN		KSLAAAAPNG		NSSSNSWEEG		SSGSSSDEEH
GGGGMRVGPQ		YQAVVPDFDP		AKLARRSQER		DNLGMLVWSP		NQNLSEAKLD
EYIAIAKEKH		GYNMEQALGM		LFWHKHNIEK		SLADLPNFTP		FPDEWTVEDK
VLFEQAFSFH		GKTFHRIQQM		LPDKSIASLV		KFYYSWKKTR		TKTSVMDRHA
RKQKREREES		EDELEEANGN		NPIDIEVDQN		KESKKEVPPT		ETVPQVKKEK
HSTQAKNRAK		RKPPKGMFLS		QEDVEAVSAN		ATAATTVLRQ		LDMELVSVKR
QIQNIKQTNS		ALKEKLDGGI		EPYRLPEVIQ		KCNARWTTEE		QLLAVQAIRK
YGRDFQAISD		VIGNKSVVQV		KNFFVNYRRR		FNIDEVLQEW		EAEHGKEETN
GPSNQKPVKS		PDNSIKMPEE		EDEAPVLDVR		YASAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• You A., Tong J.K., Grozinger C.M., Schreiber S.L. (2001). CoREST is an integral component of the CoREST-human histone deacetylase complex. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 1454—1458. PMID 11171972 DOI:10.1073/pnas.98.4.1454
• Hakimi M.-A., Dong Y., Lane W.S., Speicher D.W., Shiekhattar R. (2003). A candidate X-linked mental retardation gene is a component of a new family of histone deacetylase-containing complexes. J. Biol. Chem. 278: 7234—7239. PMID 12493763 DOI:10.1074/jbc.M208992200
• Lee M.G., Wynder C., Cooch N., Shiekhattar R. (2005). An essential role for CoREST in nucleosomal histone 3 lysine 4 demethylation. Nature. 437: 432—435. PMID 16079794 DOI:10.1038/nature04021
• Gu H., Liang Y., Mandel G., Roizman B. (2005). Components of the REST/CoREST/histone deacetylase repressor complex are disrupted, modified, and translocated in HSV-1-infected cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 7571—7576. PMID 15897453 DOI:10.1073/pnas.0502658102

Див. також

• Хромосома 14