SART1

SART1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4PYU
Ідентифікатори
Символи	SART1, Ara1, HOMS1, SART1259, SNRNP110, Snu66, squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 1, HAF, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, spliceosome associated factor 1, recruiter of U4/U6.U5 tri-snRNP
Зовнішні ІД	OMIM: 605941 MGI: 1309453 HomoloGene: 133770 GeneCards: SART1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • Тільце Кахаля • комплекс Ґольджі • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • catalytic step 2 spliceosome • spliceosomal complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck • U2-type precatalytic spliceosome Біологічний процес • mRNA cis splicing, via spliceosome • positive regulation of cytotoxic T cell differentiation • intrinsic apoptotic signaling pathway • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • maturation of 5S rRNA • spliceosomal snRNP assembly • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9092	20227
Ensembl	ENSG00000175467	ENSMUSG00000039148
UniProt	O43290	Q9Z315
RefSeq (мРНК)	NM_005146	NM_016882
RefSeq (білок)	NP_005137	NP_058578
Локус (UCSC)	Хр. 11: 65.96 – 65.98 Mb	Хр. 19: 5.43 – 5.44 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SART1 (англ. SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 800 амінокислот, а молекулярна маса — 90 255.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSSKKHRGE		KEAAGTTAAA		GTGGATEQPP		RHREHKKHKH		RSGGSGGSGG
ERRKRSRERG		GERGSGRRGA		EAEARSSTHG		RERSQAEPSE		RRVKREKRDD
GYEAAASSKT		SSGDASSLSI		EETNKLRAKL		GLKPLEVNAI		KKEAGTKEEP
VTADVINPMA		LRQREELREK		LAAAKEKRLL		NQKLGKIKTL		GEDDPWLDDT
AAWIERSRQL		QKEKDLAEKR		AKLLEEMDQE		FGVSTLVEEE		FGQRRQDLYS
ARDLQGLTVE		HAIDSFREGE		TMILTLKDKG		VLQEEEDVLV		NVNLVDKERA
EKNVELRKKK		PDYLPYAEDE		SVDDLAQQKP		RSILSKYDEE		LEGERPHSFR
LEQGGTADGL		RERELEEIRA		KLRLQAQSLS		TVGPRLASEY		LTPEEMVTFK
KTKRRVKKIR		KKEKEVVVRA		DDLLPLGDQT		QDGDFGSRLR		GRGRRRVSEV
EEEKEPVPQP		LPSDDTRVEN		MDISDEEEGG		APPPGSPQVL		EEDEAELELQ
KQLEKGRRLR		QLQQLQQLRD		SGEKVVEIVK		KLESRQRGWE		EDEDPERKGA
IVFNATSEFC		RTLGEIPTYG		LAGNREEQEE		LMDFERDEER		SANGGSESDG
EENIGWSTVN		LDEEKQQQDF		SASSTTILDE		EPIVNRGLAA		ALLLCQNKGL
LETTVQKVAR		VKAPNKSLPS		AVYCIEDKMA		IDDKYSRREE		YRGFTQDFKE
KDGYKPDVKI		EYVDETGRKL		TPKEAFRQLS		HRFHGKGSGK		MKTERRMKKL
DEEALLKKMS		SSDTPLGTVA		LLQEKQKAQK		TPYIVLSGSG		KSMNANTITK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Makarova O.V., Makarov E.M., Luehrmann R. (2001). The 65 and 110 kDa SR-related proteins of the U4/U6*U5 tri-snRNP are essential for the assembly of mature spliceosomes. EMBO J. 20: 2553—2563. PMID 11350945 DOI:10.1093/emboj/20.10.2553
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bolland D.J., Hewitt J.E. (2001). Intron loss in the SART1 genes of Fugu rubripes and Tetraodon nigroviridis. Gene. 271: 43—49. PMID 11410364 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00504-2
• Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
• Liu S., Rauhut R., Vornlocher H.-P., Luehrmann R. (2006). The network of protein-protein interactions within the human U4/U6.U5 tri-snRNP. RNA. 12: 1418—1430. PMID 16723661 DOI:10.1261/rna.55406
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111

Див. також

• Хромосома 11