SART3

SART3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DO4, 5JJW, 5JJX, 5CTT, 5CTR, 5JPZ, 5CTQ
Ідентифікатори
Символи	SART3, DSAP1, P100, RP11-13G14, TIP110, p110, p110(nrb), squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3, squamous cell carcinoma antigen recognized by T cells 3, spliceosome associated factor 3, U4/U6 recycling protein
Зовнішні ІД	OMIM: 611684 MGI: 1858230 HomoloGene: 40977 GeneCards: SART3
Онтологія гена Молекулярна функція • U6atac snRNA binding • GO:0031493 histone binding • U4 snRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • ubiquitin-specific protease binding • U6 snRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • Тільце Кахаля • nuclear speck • U4/U6 x U5 tri-snRNP complex • нуклеоплазма • U4/U6 snRNP • U6atac snRNP • U4atac/U6atac snRNP • клітинне ядро • ASAP complex Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • nucleosome assembly • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • spliceosomal tri-snRNP complex assembly • homeostasis of number of cells • positive regulation of histone deubiquitination • hematopoietic stem cell proliferation • mRNA processing • spliceosomal snRNP assembly • GO:0000767 cell morphogenesis • Сплайсинг РНК • регуляція експресії генів • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9733	53890
Ensembl	ENSG00000075856	ENSMUSG00000018974
UniProt	Q15020	Q9JLI8
RefSeq (мРНК)	NM_014706	NM_016926 NM_001356621 NM_001356623
RefSeq (білок)	NP_055521	NP_058622 NP_001343550 NP_001343552
Локус (UCSC)	Хр. 12: 108.52 – 108.56 Mb	Хр. 5: 113.88 – 113.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SART3 (англ. Squamous cell carcinoma antigen recognized by T-cells 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 963 амінокислот, а молекулярна маса — 109 935.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATAAETSAS		EPEAESKAGP		KADGEEDEVK		AARTRRKVLS		RAVAAATYKT
MGPAWDQQEE		GVSESDGDEY		AMASSAESSP		GEYEWEYDEE		EEKNQLEIER
LEEQLSINVY		DYNCHVDLIR		LLRLEGELTK		VRMARQKMSE		IFPLTEELWL
EWLHDEISMA		QDGLDREHVY		DLFEKAVKDY		ICPNIWLEYG		QYSVGGIGQK
GGLEKVRSVF		ERALSSVGLH		MTKGLALWEA		YREFESAIVE		AARLEKVHSL
FRRQLAIPLY		DMEATFAEYE		EWSEDPIPES		VIQNYNKALQ		QLEKYKPYEE
ALLQAEAPRL		AEYQAYIDFE		MKIGDPARIQ		LIFERALVEN		CLVPDLWIRY
SQYLDRQLKV		KDLVLSVHNR		AIRNCPWTVA		LWSRYLLAME		RHGVDHQVIS
VTFEKALNAG		FIQATDYVEI		WQAYLDYLRR		RVDFKQDSSK		ELEELRAAFT
RALEYLKQEV		EERFNESGDP		SCVIMQNWAR		IEARLCNNMQ		KARELWDSIM
TRGNAKYANM		WLEYYNLERA		HGDTQHCRKA		LHRAVQCTSD		YPEHVCEVLL
TMERTEGSLE		DWDIAVQKTE		TRLARVNEQR		MKAAEKEAAL		VQQEEEKAEQ
RKRARAEKKA		LKKKKKIRGP		EKRGADEDDE		KEWGDDEEEQ		PSKRRRVENS
IPAAGETQNV		EVAAGPAGKC		AAVDVEPPSK		QKEKAASLKR		DMPKVLHDSS
KDSITVFVSN		LPYSMQEPDT		KLRPLFEACG		EVVQIRPIFS		NRGDFRGYCY
VEFKEEKSAL		QALEMDRKSV		EGRPMFVSPC		VDKSKNPDFK		VFRYSTSLEK
HKLFISGLPF		SCTKEELEEI		CKAHGTVKDL		RLVTNRAGKP		KGLAYVEYEN
ESQASQAVMK		MDGMTIKENI		IKVAISNPPQ		RKVPEKPETR		KAPGGPMLLP
QTYGARGKGR		TQLSLLPRAL		QRPSAAAPQA		ENGPAAAPAV		AAPAATEAPK
MSNADFAKLF		LRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг мРНК, сплайсинг мРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Liu Y., Li J., Kim B.O., Pace B.S., He J.J. (2002). HIV-1 Tat protein-mediated transactivation of the HIV-1 long terminal repeat promoter is potentiated by a novel nuclear Tat-interacting protein of 110 kDa, Tip110. J. Biol. Chem. 277: 23854—23863. PMID 11959860 DOI:10.1074/jbc.M200773200
• Nagase T., Seki N., Tanaka A., Ishikawa K., Nomura N. (1995). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. IV. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0121-KIAA0160) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 2: 167—174. PMID 8590280 DOI:10.1093/dnares/2.4.167
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Bell M., Schreiner S., Damianov A., Reddy R., Bindereif A. (2002). p110, a novel human U6 snRNP protein and U4/U6 snRNP recycling factor. EMBO J. 21: 2724—2735. PMID 12032085 DOI:10.1093/emboj/21.11.2724
• Stanek D., Rader S.D., Klingauf M., Neugebauer K.M. (2003). Targeting of U4/U6 small nuclear RNP assembly factor SART3/p110 to Cajal bodies. J. Cell Biol. 160: 505—516. PMID 12578909 DOI:10.1083/jcb.200210087
• Damianov A., Schreiner S., Bindereif A. (2004). Recycling of the U12-type spliceosome requires p110, a component of the U6atac snRNP. Mol. Cell. Biol. 24: 1700—1708. PMID 14749385 DOI:10.1128/MCB.24.4.1700-1708.2004

Див. також

• Хромосома 12