SENP3

SENP3
Ідентифікатори
Символи	SENP3, SMT3IP1, SSP3, Ulp1, SUMO1/sentrin/SMT3 specific peptidase 3, SUMO specific peptidase 3
Зовнішні ІД	OMIM: 612844 MGI: 2158736 HomoloGene: 9236 GeneCards: SENP3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • endopeptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity Клітинна компонента • цитоплазма • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма • MLL1 complex Біологічний процес • протеоліз • rRNA processing • protein desumoylation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26168	80886
Ensembl	ENSG00000161956	ENSMUSG00000005204
UniProt	Q9H4L4	Q9EP97
RefSeq (мРНК)	NM_015670	NM_001163571 NM_030702
RefSeq (білок)	NP_056485	NP_001157043 NP_109627
Локус (UCSC)	Хр. 17: 7.56 – 7.57 Mb	Хр. 11: 69.56 – 69.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SENP3 (англ. SUMO1/sentrin/SMT3 specific peptidase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 574 амінокислот, а молекулярна маса — 65 010.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKETIQGTGS		WGPEPPGPGI		PPAYSSPRRE		RLRWPPPPKP		RLKSGGGFGP
DPGSGTTVPA		RRLPVPRPSF		DASASEEEEE		EEEEEDEDEE		EEVAAWRLPP
RWSQLGTSQR		PRPSRPTHRK		TCSQRRRRAM		RAFRMLLYSK		STSLTFHWKL
WGRHRGRRRG		LAHPKNHLSP		QQGGATPQVP		SPCCRFDSPR		GPPPPRLGLL
GALMAEDGVR		GSPPVPSGPP		MEEDGLRWTP		KSPLDPDSGL		LSCTLPNGFG
GQSGPEGERS		LAPPDASILI		SNVCSIGDHV		AQELFQGSDL		GMAEEAERPG
EKAGQHSPLR		EEHVTCVQSI		LDEFLQTYGS		LIPLSTDEVV		EKLEDIFQQE
FSTPSRKGLV		LQLIQSYQRM		PGNAMVRGFR		VAYKRHVLTM		DDLGTLYGQN
WLNDQVMNMY		GDLVMDTVPE		KVHFFNSFFY		DKLRTKGYDG		VKRWTKNVDI
FNKELLLIPI		HLEVHWSLIS		VDVRRRTITY		FDSQRTLNRR		CPKHIAKYLQ
AEAVKKDRLD		FHQGWKGYFK		MNVARQNNDS		DCGAFVLQYC		KHLALSQPFS
FTQQDMPKLR		RQIYKELCHC		KLTV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Yeh E.T.H., Gong L., Kamitani T. (2000). Ubiquitin-like proteins: new wines in new bottles. Gene. 248: 1—14. PMID 10806345 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00139-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Gregoire S., Yang X.-J. (2005). Association with class IIa histone deacetylases upregulates the sumoylation of MEF2 transcription factors. Mol. Cell. Biol. 25: 2273—2287. PMID 15743823 DOI:10.1128/MCB.25.6.2273-2287.2005
• Gong L., Yeh E.T.H. (2006). Characterization of a family of nucleolar SUMO-specific proteases with preference for SUMO-2 or SUMO-3. J. Biol. Chem. 281: 15869—15877. PMID 16608850 DOI:10.1074/jbc.M511658200
• Haindl M., Harasim T., Eick D., Muller S. (2008). The nucleolar SUMO-specific protease SENP3 reverses SUMO modification of nucleophosmin and is required for rRNA processing. EMBO Rep. 9: 273—279. PMID 18259216 DOI:10.1038/embor.2008.3
• Klein U.R., Haindl M., Nigg E.A., Muller S. (2009). RanBP2 and SENP3 function in a mitotic SUMO2/3 conjugation-deconjugation cycle on Borealin. Mol. Biol. Cell. 20: 410—418. PMID 18946085 DOI:10.1091/mbc.E08-05-0511

Див. також

• Хромосома 17