SENP6

SENP6
Ідентифікатори
Символи	SENP6, SSP1, SUSP1, SUMO1/sentrin specific peptidase 6, SUMO specific peptidase 6
Зовнішні ІД	OMIM: 605003 MGI: 1922075 HomoloGene: 9196 GeneCards: SENP6
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • SUMO-specific endopeptidase activity Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • цитоплазма Біологічний процес • protein desumoylation • protein modification by small protein removal • regulation of spindle assembly • protein sumoylation • протеоліз • regulation of kinetochore assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	26054	215351
Ensembl	ENSG00000112701	ENSMUSG00000034252
UniProt	Q9GZR1	Q6P7W0
RefSeq (мРНК)	NM_001100409 NM_001304792 NM_015571	NM_146003 NM_001311110
RefSeq (білок)	NP_001093879 NP_001291721 NP_056386	NP_001298039 NP_666115
Локус (UCSC)	Хр. 6: 75.6 – 75.72 Mb	Хр. 9: 80.07 – 80.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SENP6 (англ. SUMO1/sentrin specific peptidase 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 112 амінокислот, а молекулярна маса — 126 146.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAGKSGGSA		GEITFLEALA		RSESKRDGGF		KNNWSFDHEE		ESEGDTDKDG
TNLLSVDEDE		DSETSKGKKL		NRRSEIVANS		SGEFILKTYV		RRNKSESFKT
LKGNPIGLNM		LSNNKKLSEN		TQNTSLCSGT		VVHGRRFHHA		HAQIPVVKTA
AQSSLDRKER		KEYPPHVQKV		EINPVRLSRL		QGVERIMKKT		EESESQVEPE
IKRKVQQKRH		CSTYQPTPPL		SPASKKCLTH		LEDLQRNCRQ		AITLNESTGP
LLRTSIHQNS		GGQKSQNTGL		TTKKFYGNNV		EKVPIDIIVN		CDDSKHTYLQ
TNGKVILPGA		KIPKITNLKE		RKTSLSDLND		PIILSSDDDD		DNDRTNRRES
ISPQPADSAC		SSPAPSTGKV		EAALNENTCR		AERELRSIPE		DSELNTVTLP
RKARMKDQFG		NSIINTPLKR		RKVFSQEPPD		ALALSCQSSF		DSVILNCRSI
RVGTLFRLLI		EPVIFCLDFI		KIQLDEPDHD		PVEIILNTSD		LTKCEWCNVR
KLPVVFLQAI		PAVYQKLSIQ		LQMNKEDKVW		NDCKGVNKLT		NLEEQYIILI
FQNGLDPPAN		MVFESIINEI		GIKNNISNFF		AKIPFEEANG		RLVACTRTYE
ESIKGSCGQK		ENKIKTVSFE		SKIQLRSKQE		FQFFDEEEET		GENHTIFIGP
VEKLIVYPPP		PAKGGISVTN		EDLHCLNEGE		FLNDVIIDFY		LKYLVLEKLK
KEDADRIHIF		SSFFYKRLNQ		RERRNHETTN		LSIQQKRHGR		VKTWTRHVDI
FEKDFIFVPL		NEAAHWFLAV		VCFPGLEKPK		YEPNPHYHEN		AVIQKCSTVE
DSCISSSASE		MESCSQNSSA		KPVIKKMLNK		KHCIAVIDSN		PGQEESDPRY
KRNICSVKYS		VKKINHTASE		NEEFNKGEST		SQKVADRTKS		ENGLQNESLS
STHHTDGLSK		IRLNYSDESP		EAGKMLEDEL		VDFSEDQDNQ		DDSSDDGFLA
DDNCSSEIGQ		WHLKPTICKQ		PCILLMDSLR		GPSRSNVVKI		LREYLEVEWE
VKKGSKRSFS		KDVMKGSNPK		VPQQNNFSDC		GVYVLQYVES		FFENPILSFE
LPMNLANWFP		PPRMRTKREE		IRNIILKLQE		DQSKEKRKHK		DTYSTEAPLG
EGTEQYVNSI		SD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Локалізований у ядрі.

Література

• Yeh E.T.H., Gong L., Kamitani T. (2000). Ubiquitin-like proteins: new wines in new bottles. Gene. 248: 1—14. PMID 10806345 DOI:10.1016/S0378-1119(00)00139-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lima C.D., Reverter D. (2008). Structure of the human SENP7 catalytic domain and poly-SUMO deconjugation activities for SENP6 and SENP7. J. Biol. Chem. 283: 32045—32055. PMID 18799455 DOI:10.1074/jbc.M805655200
• Mukhopadhyay D., Arnaoutov A., Dasso M. (2010). The SUMO protease SENP6 is essential for inner kinetochore assembly. J. Cell Biol. 188: 681—692. PMID 20212317 DOI:10.1083/jcb.200909008
• Dou H., Huang C., Singh M., Carpenter P.B., Yeh E.T. (2010). Regulation of DNA repair through desumoylation and sumoylation of replication protein A complex. Mol. Cell. 39: 333—345. PMID 20705237 DOI:10.1016/j.molcel.2010.07.021
• Hattersley N., Shen L., Jaffray E.G., Hay R.T. (2011). The SUMO protease SENP6 is a direct regulator of PML nuclear bodies. Mol. Biol. Cell. 22: 78—90. PMID 21148299 DOI:10.1091/mbc.E10-06-0504

Див. також

• Хромосома 6