SMC4

SMC4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4U4P
Ідентифікатори
Символи	SMC4, CAP-C, CAPC, SMC-4, SMC4L1, hCAP-C, structural maintenance of chromosomes 4
Зовнішні ІД	OMIM: 605575 MGI: 1917349 HomoloGene: 4015 GeneCards: SMC4
Онтологія гена Молекулярна функція • protein heterodimerization activity • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • single-stranded DNA binding Клітинна компонента • хромосома • клітинне ядро • Конденсин • нуклеоплазма • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck Біологічний процес • mitotic sister chromatid segregation • meiotic chromosome segregation • поділ клітини • клітинний цикл • kinetochore organization • mitotic chromosome condensation • meiotic chromosome condensation • chromosome condensation • GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10051	70099
Ensembl	ENSG00000113810	ENSMUSG00000034349
UniProt	Q9NTJ3	Q8CG47
RefSeq (мРНК)	NM_001002799 NM_001002800 NM_001288753 NM_005496	NM_133786 NM_001356976
RefSeq (білок)	NP_001002800 NP_001275682 NP_005487	NP_598547 NP_001343905
Локус (UCSC)	Хр. 3: 160.4 – 160.43 Mb	Хр. 3: 68.91 – 68.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMC4 (англ. Structural maintenance of chromosomes 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 288 амінокислот, а молекулярна маса — 147 182.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPRKGTQPST		ARRREEGPPP		PSPDGASSDA		EPEPPSGRTE		SPATAAETAS
EELDNRSLEE		ILNSIPPPPP		PAMTNEAGAP		RLMITHIVNQ		NFKSYAGEKI
LGPFHKRFSC		IIGPNGSGKS		NVIDSMLFVF		GYRAQKIRSK		KLSVLIHNSD
EHKDIQSCTV		EVHFQKIIDK		EGDDYEVIPN		SNFYVSRTAC		RDNTSVYHIS
GKKKTFKDVG		NLLRSHGIDL		DHNRFLILQG		EVEQIAMMKP		KGQTEHDEGM
LEYLEDIIGC		GRLNEPIKVL		CRRVEILNEH		RGEKLNRVKM		VEKEKDALEG
EKNIAIEFLT		LENEIFRKKN		HVCQYYIYEL		QKRIAEMETQ		KEKIHEDTKE
INEKSNILSN		EMKAKNKDVK		DTEKKLNKIT		KFIEENKEKF		TQLDLEDVQV
REKLKHATSK		AKKLEKQLQK		DKEKVEEFKS		IPAKSNNIIN		ETTTRNNALE
KEKEKEEKKL		KEVMDSLKQE		TQGLQKEKES		REKELMGFSK		SVNEARSKMD
VAQSELDIYL		SRHNTAVSQL		TKAKEALIAA		SETLKERKAA		IRDIEGKLPQ
TEQELKEKEK		ELQKLTQEET		NFKSLVHDLF		QKVEEAKSSL		AMNRSRGKVL
DAIIQEKKSG		RIPGIYGRLG		DLGAIDEKYD		VAISSCCHAL		DYIVVDSIDI
AQECVNFLKR		QNIGVATFIG		LDKMAVWAKK		MTEIQTPENT		PRLFDLVKVK
DEKIRQAFYF		ALRDTLVADN		LDQATRVAYQ		KDRRWRVVTL		QGQIIEQSGT
MTGGGSKVMK		GRMGSSLVIE		ISEEEVNKME		SQLQNDSKKA		MQIQEQKVQL
EERVVKLRHS		EREMRNTLEK		FTASIQRLIE		QEEYLNVQVK		ELEANVLATA
PDKKKQKLLE		ENVSAFKTEY		DAVAEKAGKV		EAEVKRLHNT		IVEINNHKLK
AQQDKLDKIN		KQLDECASAI		TKAQVAIKTA		DRNLQKAQDS		VLRTEKEIKD
TEKEVDDLTA		ELKSLEDKAA		EVVKNTNAAE		ESLPEIQKEH		RNLLQELKVI
QENEHALQKD		ALSIKLKLEQ		IDGHIAEHNS		KIKYWHKEIS		KISLHPIEDN
PIEEISVLSP		EDLEAIKNPD		SITNQIALLE		ARCHEMKPNL		GAIAEYKKKE
ELYLQRVAEL		DKITYERDSF		RQAYEDLRKQ		RLNEFMAGFY		IITNKLKENY
QMLTLGGDAE		LELVDSLDPF		SEGIMFSVRP		PKKSWKKIFN		LSGGEKTLSS
LALVFALHHY		KPTPLYFMDE		IDAALDFKNV		SIVAFYIYEQ		TKNAQFIIIS
LRNNMFEISD		RLIGIYKTYN		ITKSVAVNPK		EIASKGLC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинний цикл, поділ клітини, мітоз, конденсація ДНК, поліморфізм, ацетиляція, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, хромосомах.

Література

• Schmiesing J.A., Gregson H.C., Zhou S., Yokomori K. (2000). A human condensin complex containing hCAP-C-hCAP-E and CNAP1, a homolog of Xenopus XCAP-D2, colocalizes with phosphorylated histone H3 during the early stage of mitotic chromosome condensation. Mol. Cell. Biol. 20: 6996—7006. PMID 10958694 DOI:10.1128/MCB.20.18.6996-7006.2000
• Kimura K., Cuvier O., Hirano T. (2001). Chromosome condensation by a human condensin complex in Xenopus egg extracts. J. Biol. Chem. 276: 5417—5420. PMID 11136719 DOI:10.1074/jbc.C000873200
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Див. також

• Хромосома 3