SNAPC4

SNAPC4
Ідентифікатори
Символи	SNAPC4, PTFalpha, SNAP190, small nuclear RNA activating complex polypeptide 4
Зовнішні ІД	OMIM: 602777 MGI: 2443935 HomoloGene: 2321 GeneCards: SNAPC4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • snRNA-activating protein complex Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • snRNA transcription by RNA polymerase III • transcription by RNA polymerase III • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • snRNA transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • snRNA transcription Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6621	227644
Ensembl	ENSG00000165684	ENSMUSG00000036281
UniProt	Q5SXM2	Q8BP86
RefSeq (мРНК)	NM_003086 NM_001394201 NM_001394202 NM_001394203	NM_001290419 NM_172339
RefSeq (білок)	NP_003077	NP_001277348 NP_758842 NP_001393660 NP_001393661 NP_001393662 NP_001393663 NP_001393664 NP_001393665 NP_001393666 NP_001393667 NP_001393668
Локус (UCSC)	Хр. 9: 136.38 – 136.4 Mb	Хр. 2: 26.25 – 26.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNAPC4 (англ. Small nuclear RNA activating complex polypeptide 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 469 амінокислот, а молекулярна маса — 159 433.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDVDAEREKI		TQEIKELERI		LDPGSSGSHV		EISESSLESD		SEADSLPSED
LDPADPPISE		EERWGEASND		EDDPKDKTLP		EDPETCLQLN		MVYQEVIQEK
LAEANLLLAQ		NREQQEELMR		DLAGSKGTKV		KDGKSLPPST		YMGHFMKPYF
KDKVTGVGPP		ANEDTREKAA		QGIKAFEELL		VTKWKNWEKA		LLRKSVVSDR
LQRLLQPKLL		KLEYLHQKQS		KVSSELERQA		LEKQGREAEK		EIQDINQLPE
EALLGNRLDS		HDWEKISNIN		FEGSRSAEEI		RKFWQNSEHP		SINKQEWSRE
EEERLQAIAA		AHGHLEWQKI		AEELGTSRSA		FQCLQKFQQH		NKALKRKEWT
EEEDRMLTQL		VQEMRVGSHI		PYRRIVYYME		GRDSMQLIYR		WTKSLDPGLK
KGYWAPEEDA		KLLQAVAKYG		EQDWFKIREE		VPGRSDAQCR		DRYLRRLHFS
LKKGRWNLKE		EEQLIELIEK		YGVGHWAKIA		SELPHRSGSQ		CLSKWKIMMG
KKQGLRRRRR		RARHSVRWSS		TSSSGSSSGS		SGGSSSSSSS		SSEEDEPEQA
QAGEGDRALL		SPQYMVPDMD		LWVPARQSTS		QPWRGGAGAW		LGGPAASLSP
PKGSSASQGG		SKEASTTAAA		PGEETSPVQV		PARAHGPVPR		SAQASHSADT
RPAGAEKQAL		EGGRRLLTVP		VETVLRVLRA		NTAARSCTQK		EQLRQPPLPT
SSPGVSSGDS		VARSHVQWLR		HRATQSGQRR		WRHALHRRLL		NRRLLLAVTP
WVGDVVVPCT		QASQRPAVVQ		TQADGLREQL		QQARLASTPV		FTLFTQLFHI
DTAGCLEVVR		ERKALPPRLP		QAGARDPPVH		LLQASSSAQS		TPGHLFPNVP
AQEASKSASH		KGSRRLASSR		VERTLPQASL		LASTGPRPKP		KTVSELLQEK
RLQEARAREA		TRGPVVLPSQ		LLVSSSVILQ		PPLPHTPHGR		PAPGPTVLNV
PLSGPGAPAA		AKPGTSGSWQ		EAGTSAKDKR		LSTMQALPLA		PVFSEAEGTA
PAASQAPALG		PGQISVSCPE		SGLGQSQAPA		ASRKQGLPEA		PPFLPAAPSP
TPLPVQPLSL		THIGGPHVAT		SVPLPVTWVL		TAQGLLPVPV		PAVVSLPRPA
GTPGPAGLLA		TLLPPLTETR		AAQGPRAPAL		SSSWQPPANM		NREPEPSCRT
DTPAPPTHAL		SQSPAEADGS		VAFVPGEAQV		AREIPEPRTS		SHADPPEAEP
PWSGRLPAFG		GVIPATEPRG		TPGSPSGTQE		PRGPLGLEKL		PLRQPGPEKG
ALDLEKPPLP		QPGPEKGALD		LGLLSQEGEA		ATQQWLGGQR		GVRVPLLGSR
LPYQPPALCS		LRALSGLLLH		KKALEHKATS		LVVGGEAERP		AGALQASLGL
VRGQLQDNPA		YLLLRARFLA		AFTLPALLAT		LAPQGVRTTL		SVPSRVGSES
EDEDLLSELE		LADRDGQPGC		TTATCPIQGA		PDSGKCSASS		CLDTSNDPDD
LDVLRTRHAR		HTRKRRRLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Ma B., Hernandez N. (2001). A map of protein-protein contacts within the small nuclear RNA-activating protein complex SNAPc. J. Biol. Chem. 276: 5027—5035. PMID 11056176 DOI:10.1074/jbc.M009301200
• Hinkley C.S., Hirsch H.A., Gu L., LaMere B., Henry R.W. (2003). The small nuclear RNA-activating protein 190 Myb DNA binding domain stimulates TATA box-binding protein-TATA box recognition. J. Biol. Chem. 278: 18649—18657. PMID 12621023 DOI:10.1074/jbc.M204247200

Див. також

• Хромосома 9