SNCAIP

SNCAIP
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KES
Ідентифікатори
Символи	SNCAIP, SYPH1, Sph1, synuclein alpha interacting protein
Зовнішні ІД	OMIM: 603779 MGI: 1915097 HomoloGene: 3987 GeneCards: SNCAIP
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ubiquitin protein ligase binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • neuronal cell body • presynaptic membrane • Синаптичні бульбашки • нуклеоплазма • cytoplasmic ribonucleoprotein granule Біологічний процес • regulation of inclusion body assembly • dopamine metabolic process • смерть клітини • regulation of neurotransmitter secretion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9627	67847
Ensembl	ENSG00000064692	ENSMUSG00000024534
UniProt	Q9Y6H5	Q99ME3
RefSeq (мРНК)	NM_001242935 NM_001308100 NM_001308105 NM_001308106 NM_001308107 NM_001308108 NM_001308109 NM_005460	NM_001199151 NM_001199153 NM_001199154 NM_026408
RefSeq (білок)	NP_001229864 NP_001295029 NP_001295034 NP_001295035 NP_001295036 NP_001295037 NP_001295038 NP_005451	NP_001186080 NP_001186082 NP_001186083 NP_080684 NP_001390575 NP_001390576 NP_001390577
Локус (UCSC)	Хр. 5: 122.31 – 122.46 Mb	Хр. 18: 52.9 – 53.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNCAIP (англ. Synuclein alpha interacting protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 919 амінокислот, а молекулярна маса — 100 409.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEAPEYLDLD		EIDFSDDISY		SVTSLKTIPE		LCRRCDTQNE		DRSVSSSSWN
CGISTLITNT		QKPTGIADVY		SKFRPVKRVS		PLKHQPETLE		NNESDDQKNQ
KVVEYQKGGE		SDLGPQPQEL		GPGDGVGGPP		GKSSEPSTSL		GELEHYDLDM
DEILDVPYIK		SSQQLASFTK		VTSEKRILGL		CTTINGLSGK		ACSTGSSESS
SSNMAPFCVL		SPVKSPHLRK		ASAVIHDQHK		LSTEETEISP		PLVKCGSAYE
PENQSKDFLN		KTFSDPHGRK		VEKTTPDCQL		RAFHLQSSAA		ESKPEEQVSG
LNRTSSQGPE		ERSEYLKKVK		SILNIVKEGQ		ISLLPHLAAD		NLDKIHDENG
NNLLHIAASQ		GHAECLQHLT		SLMGEDCLNE		RNTEKLTPAG		LAIKNGQLEC
VRWMVSETEA		IAELSCSKDF		PSLIHYAGCY		GQEKILLWLL		QFMQEQGISL
DEVDQDGNSA		VHVASQHGYL		GCIQTLVEYG		ANVTMQNHAG		EKPSQSAERQ
GHTLCSRYLV		VVETCMSLAS		QVVKLTKQLK		EQTVERVTLQ		NQLQQFLEAQ
KSEGKSLPSS		PSSPSSPASR		KSQWKSPDAD		DDSVAKSKPG		VQEGIQVLGS
LSASSRARPK		AKDEDSDKIL		RQLLGKEISE		NVCTQEKLSL		EFQDAQASSR
NSKKIPLEKR		ELKLARLRQL		MQRSLSESDT		DSNNSEDPKT		TPVRKADRPR
PQPIVESVES		MDSAESLHLM		IKKHTLASGG		RRFPFSIKAS		KSLDGHSPSP
TSESSEPDLE		SQYPGSGSIP		PNQPSGDPQQ		PSPDSTAAQK		VATSPKSALK
SPSSKRRTSQ		NLKLRVTFEE		PVVQMEQPSL		ELNGEKDKDK		GRTLQRTSTS
NESGDQLKRP		FGAFRSIMET		LSGNQNNNNN		YQAANQLKTS		TLPLTSLGRK
TDAKGNPASS		ASKGKNKAA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Myhre R., Klungland H., Farrer M.J., Aasly J.O. (2008). Genetic association study of synphilin-1 in idiopathic Parkinson's disease. BMC Med. Genet. 9: 19—19. PMID 18366718 DOI:10.1186/1471-2350-9-19

Див. також

• Хромосома 5