TERF2

TERF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1H6P, 1VF9, 1VFC, 1W0U, 1XG1, 3BU8, 3BUA, 3K6G, 3SJM, 4M7C, 4RQI
Ідентифікатори
Символи	TERF2, TRBF2, TRF2, telomeric repeat binding factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 602027 MGI: 1195972 HomoloGene: 4133 GeneCards: TERF2
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • double-stranded telomeric DNA binding • protein homodimerization activity • telomeric DNA binding • telomerase activity • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • G-rich strand telomeric DNA binding • enzyme binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • nuclear telomere cap complex • хромосома • теломера • Mre11 complex • клітинне ядро • нуклеоплазма • ядерні тільця • shelterin complex • axon cytoplasm Біологічний процес • negative regulation of telomere single strand break repair • regulation of telomere maintenance • negative regulation of telomere maintenance via semi-conservative replication • negative regulation of gene expression • negative regulation of beta-galactosidase activity • protein localization to chromosome, telomeric region • клітинне старіння • negative regulation of telomere capping • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of nitric-oxide synthase activity • negative regulation of t-circle formation • клітинний цикл • telomeric loop formation • negative regulation of cellular senescence • telomere capping • negative regulation of telomere maintenance via telomere lengthening • negative regulation of exonuclease activity • telomeric D-loop disassembly • negative regulation of telomeric D-loop disassembly • negative regulation of telomere maintenance via recombination • telomere maintenance • RNA-dependent DNA biosynthetic process • negative regulation of telomere maintenance • regulation of telomere maintenance via telomerase • negative regulation of telomere maintenance via telomerase • protection from non-homologous end joining at telomere • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anterograde axonal transport of messenger ribonucleoprotein complex Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7014	21750
Ensembl	ENSG00000132604	ENSMUSG00000031921
UniProt	Q15554	O35144
RefSeq (мРНК)	NM_005652	NM_001083118 NM_001286200 NM_009353
RefSeq (білок)	NP_005643	NP_001076587 NP_001273129 NP_033379 NP_001357994 NP_001357995 NP_001357996
Локус (UCSC)	Хр. 16: 69.36 – 69.41 Mb	Хр. 8: 107.07 – 107.1 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TERF2 (англ. Telomeric repeat binding factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 542 амінокислот, а молекулярна маса — 59 594.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAGAGTAGP		ASGPGVVRDP		AASQPRKRPG		REGGEGARRS		DTMAGGGGSS
DGSGRAAGRR		ASRSSGRARR		GRHEPGLGGP		AERGAGEARL		EEAVNRWVLK
FYFHEALRAF		RGSRYGDFRQ		IRDIMQALLV		RPLGKEHTVS		RLLRVMQCLS
RIEEGENLDC		SFDMEAELTP		LESAINVLEM		IKTEFTLTEA		VVESSRKLVK
EAAVIICIKN		KEFEKASKIL		KKHMSKDPTT		QKLRNDLLNI		IREKNLAHPV
IQNFSYETFQ		QKMLRFLESH		LDDAEPYLLT		MAKKALKSES		AASSTGKEDK
QPAPGPVEKP		PREPARQLRN		PPTTIGMMTL		KAAFKTLSGA		QDSEAAFAKL
DQKDLVLPTQ		ALPASPALKN		KRPRKDENES		SAPADGEGGS		ELQPKNKRMT
ISRLVLEEDS		QSTEPSAGLN		SSQEAASAPP		SKPTVLNQPL		PGEKNPKVPK
GKWNSSNGVE		EKETWVEEDE		LFQVQAAPDE		DSTTNITKKQ		KWTVEESEWV
KAGVQKYGEG		NWAAISKNYP		FVNRTAVMIK		DRWRTMKRLG		MN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинний цикл, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі, хромосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Broccoli D., Smogorzewska A., Chong L., de Lange T. (1997). Human telomeres contain two distinct Myb-related proteins, TRF1 and TRF2. Nat. Genet. 17: 231—235. PMID 9326950 DOI:10.1038/ng1097-231
• van Steensel B., Smogorzewska A., de Lange T. (1998). TRF2 protects human telomeres from end-to-end fusions. Cell. 92: 401—413. PMID 9476899 DOI:10.1016/S0092-8674(00)80932-0
• Zhu X.-D., Kuester B., Mann M., Petrini J.H.J., de Lange T. (2000). Cell-cycle-regulated association of RAD50/MRE11/NBS1 with TRF2 and human telomeres. Nat. Genet. 25: 347—352. PMID 10888888 DOI:10.1038/77139
• Liu D., O'Connor M.S., Qin J., Songyang Z. (2004). Telosome, a mammalian telomere-associated complex formed by multiple telomeric proteins. J. Biol. Chem. 279: 51338—51342. PMID 15383534 DOI:10.1074/jbc.M409293200
• de Lange T. (2005). Shelterin: the protein complex that shapes and safeguards human telomeres. Genes Dev. 19: 2100—2110. PMID 16166375 DOI:10.1101/gad.1346005

Див. також

• Хромосома 16